21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1650 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1650  hypothetical protein  100 
 
 		 435 aa  850    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.161502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3838  hypothetical protein  82.76 
 
 		 436 aa  623  1e-177  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.44323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4469  hypothetical protein  61.74 
 
 		 422 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2800  O-antigen polymerase  28.66 
 
 		 422 aa  72.4  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66100  hypothetical protein  30.47 
 
 		 399 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3150  O-antigen polymerase  25.71 
 
 		 388 aa  46.6  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.9572 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0279  O-antigen polymerase family protein  29.29 
 
 		 595 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.297863  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0480  O-antigen polymerase  26.63 
 
 		 620 aa  46.2  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.450132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0010  O-antigen polymerase family protein  29.29 
 
 		 595 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2679  O-antigen polymerase family protein  29.29 
 
 		 595 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2397  O-antigen polymerase family protein  29.29 
 
 		 595 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233574  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0821  O-antigen polymerase family protein  29.29 
 
 		 595 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0980  O-antigen polymerase family protein  29.29 
 
 		 661 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0314  O-antigen polymerase  25.08 
 
 		 397 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0817  O-antigen polymerase family protein  28.99 
 
 		 595 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0650  O-antigen polymerase family protein  29.71 
 
 		 595 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4673  O-antigen polymerase  28.4 
 
 		 560 aa  44.3  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0657  O-antigen polymerase  28.87 
 
 		 593 aa  43.5  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2674  O-antigen polymerase  28.57 
 
 		 592 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2645  O-antigen polymerase  28.57 
 
 		 592 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2034  O-antigen polymerase  28.57 
 
 		 592 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>