47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3040 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3040  HEPN domain-containing protein  100 
 
 
132 aa  266  5e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1919  HEPN domain-containing protein  73.02 
 
 
127 aa  191  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000391131 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2346  HEPN domain-containing protein  55.28 
 
 
130 aa  144  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048246  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0237  HEPN domain-containing protein  41.46 
 
 
131 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2146  HEPN domain protein  40.68 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3437  HEPN domain-containing protein  39 
 
 
110 aa  73.9  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.216023 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3847  HEPN domain-containing protein  41.44 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000584518  unclonable  0.00000679911 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2668  HEPN domain protein  36.96 
 
 
137 aa  70.1  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0575  HEPN domain-containing protein  41.44 
 
 
131 aa  67.4  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.973071  normal  0.183085 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0103  hypothetical protein  40.78 
 
 
137 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120432  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0039  HepN domain protein  40.78 
 
 
137 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108662 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0034  hypothetical protein  40.4 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0062  HepN domain protein  40.78 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0075  HepN domain protein  35.71 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.535733  normal  0.629451 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0217  HEPN  37.07 
 
 
133 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121698  hitchhiker  0.00000000000000140907 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0573  HEPN domain-containing protein  43.3 
 
 
127 aa  62.8  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168783  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0171  HEPN domain-containing protein  36.29 
 
 
135 aa  62.8  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1958  HEPN domain-containing protein  39.47 
 
 
128 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.704012  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1620  HEPN domain-containing protein  41.46 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.24552  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1451  HEPN domain-containing protein  34.88 
 
 
133 aa  57  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0084  HEPN domain-containing protein  39.13 
 
 
107 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.395692  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1618  HEPN domain-containing protein  40.46 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.343215  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1027  HEPN domain protein  28.57 
 
 
131 aa  53.9  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000217763  normal  0.602077 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3961  HEPN domain protein  40.22 
 
 
132 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4090  HEPN domain-containing protein  31.45 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.418783  normal  0.694143 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3921  HEPN domain-containing protein  33.6 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.063981 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0040  HEPN domain protein  33.33 
 
 
134 aa  52  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2192  HEPN domain-containing protein  35.88 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.208434  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1680  HEPN  33.08 
 
 
129 aa  50.4  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00395828  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0586  HEPN domain-containing protein  31.3 
 
 
128 aa  50.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2469  HEPN domain-containing protein  40.7 
 
 
120 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.251161  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4128  HEPN domain-containing protein  32.77 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000124069 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0996  HEPN domain-containing protein  35.62 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.967932  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2161  HEPN domain-containing protein  34.65 
 
 
117 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2456  HEPN domain protein  32.35 
 
 
128 aa  43.9  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.213966  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1027  HEPN domain-containing protein  42.62 
 
 
130 aa  43.9  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.19731  normal  0.490071 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1726  HEPN domain-containing protein  35.05 
 
 
130 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177368  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1302  HEPN domain-containing protein  34.69 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.260484  normal  0.456574 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1136  HEPN domain-containing protein  47.17 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.174489 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1068  HEPN domain-containing protein  36 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.803459  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0820  HEPN domain-containing protein  40.85 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1700  HEPN domain-containing protein  38.6 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.348509 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1364  hypothetical protein  29.29 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00320209  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1360  hypothetical protein  29.29 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.20784  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1576  HEPN  31.97 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000021499  normal  0.0817706 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1698  HEPN domain-containing protein  34.15 
 
 
133 aa  40.8  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000156431  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1131  HEPN domain-containing protein  34.92 
 
 
129 aa  40.4  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>