36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3437 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3437  HEPN domain-containing protein  100 
 
 
110 aa  230  5e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.216023 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2346  HEPN domain-containing protein  47.92 
 
 
130 aa  87.4  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048246  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0034  hypothetical protein  35.71 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0575  HEPN domain-containing protein  42 
 
 
131 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.973071  normal  0.183085 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2146  HEPN domain protein  40.86 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1919  HEPN domain-containing protein  42.55 
 
 
127 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000391131 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3040  HEPN domain-containing protein  39 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3847  HEPN domain-containing protein  42 
 
 
127 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000584518  unclonable  0.00000679911 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0039  HepN domain protein  34.69 
 
 
137 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108662 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0103  hypothetical protein  34.69 
 
 
137 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120432  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0062  HepN domain protein  35.71 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0075  HepN domain protein  37.11 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.535733  normal  0.629451 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0217  HEPN  36.27 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121698  hitchhiker  0.00000000000000140907 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0237  HEPN domain-containing protein  36.73 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0573  HEPN domain-containing protein  40.2 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168783  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1576  HEPN  34.62 
 
 
132 aa  57  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000021499  normal  0.0817706 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0366  HEPN domain-containing protein  35.71 
 
 
133 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.205262 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1027  HEPN domain protein  32.67 
 
 
131 aa  55.1  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000217763  normal  0.602077 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1620  HEPN domain-containing protein  37.11 
 
 
128 aa  53.9  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.24552  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1618  HEPN domain-containing protein  39.18 
 
 
130 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.343215  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2668  HEPN domain protein  37.76 
 
 
137 aa  53.9  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0996  HEPN domain-containing protein  42.86 
 
 
97 aa  53.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.967932  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0500  hypothetical protein  32.86 
 
 
109 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0084  HEPN domain-containing protein  35.71 
 
 
107 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.395692  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2192  HEPN domain-containing protein  34.31 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.208434  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3961  HEPN domain protein  38.81 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1680  HEPN  34.62 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00395828  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1302  HEPN domain-containing protein  32.08 
 
 
136 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.260484  normal  0.456574 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1451  HEPN domain-containing protein  48.89 
 
 
133 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0040  HEPN domain protein  31.82 
 
 
134 aa  47.4  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1958  HEPN domain-containing protein  46.3 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.704012  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3921  HEPN domain-containing protein  27.1 
 
 
127 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.063981 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4090  HEPN domain-containing protein  34.83 
 
 
142 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.418783  normal  0.694143 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4128  HEPN domain-containing protein  42.19 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000124069 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2469  HEPN domain-containing protein  34.74 
 
 
120 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.251161  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1726  HEPN domain-containing protein  33.85 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>