52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1919 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1919  HEPN domain-containing protein  100 
 
 
127 aa  263  8.999999999999999e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000391131 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3040  HEPN domain-containing protein  73.02 
 
 
132 aa  191  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2346  HEPN domain-containing protein  52.85 
 
 
130 aa  136  7.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048246  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0237  HEPN domain-containing protein  38.71 
 
 
131 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3437  HEPN domain-containing protein  42.55 
 
 
110 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.216023 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2146  HEPN domain protein  37.5 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3847  HEPN domain-containing protein  40.91 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000584518  unclonable  0.00000679911 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0575  HEPN domain-containing protein  42.73 
 
 
131 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.973071  normal  0.183085 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0103  hypothetical protein  38.38 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120432  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0039  HepN domain protein  38.38 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108662 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0075  HepN domain protein  36.36 
 
 
146 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.535733  normal  0.629451 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0573  HEPN domain-containing protein  40 
 
 
127 aa  62.8  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168783  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0062  HepN domain protein  38.38 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0034  hypothetical protein  38.46 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2668  HEPN domain protein  38.14 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0084  HEPN domain-containing protein  40.22 
 
 
107 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.395692  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0217  HEPN  36.11 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121698  hitchhiker  0.00000000000000140907 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0040  HEPN domain protein  33.33 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1027  HEPN domain protein  36 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000217763  normal  0.602077 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1958  HEPN domain-containing protein  36.84 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.704012  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0171  HEPN domain-containing protein  38.89 
 
 
135 aa  54.7  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3961  HEPN domain protein  37.89 
 
 
132 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1620  HEPN domain-containing protein  41.18 
 
 
128 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.24552  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1451  HEPN domain-containing protein  35.43 
 
 
133 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2192  HEPN domain-containing protein  36.08 
 
 
140 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.208434  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0500  hypothetical protein  31.87 
 
 
109 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4090  HEPN domain-containing protein  29.6 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.418783  normal  0.694143 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0586  HEPN domain-containing protein  27.27 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3921  HEPN domain-containing protein  32.52 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.063981 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2161  HEPN domain-containing protein  40.79 
 
 
117 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1302  HEPN domain-containing protein  37.37 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.260484  normal  0.456574 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1364  hypothetical protein  31.25 
 
 
146 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00320209  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1360  hypothetical protein  31.25 
 
 
146 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.20784  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2469  HEPN domain-containing protein  36.05 
 
 
120 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.251161  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1618  HEPN domain-containing protein  35.96 
 
 
130 aa  47  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.343215  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0337  HEPN domain protein  38.3 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2456  HEPN domain protein  35.87 
 
 
128 aa  46.2  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.213966  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0462  HEPN domain-containing protein  48.15 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0996  HEPN domain-containing protein  39.34 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.967932  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2433  hypothetical protein  34.38 
 
 
133 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.340145  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1131  HEPN domain-containing protein  35.9 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1027  HEPN domain-containing protein  35.63 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.19731  normal  0.490071 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1136  HEPN domain-containing protein  39.22 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.174489 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3092  HEPN  34.02 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91565  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1680  HEPN  34.38 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00395828  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1576  HEPN  31.91 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000021499  normal  0.0817706 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2642  HEPN domain protein  40 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1700  HEPN domain-containing protein  42.86 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.348509 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0705  HEPN domain-containing protein  47.83 
 
 
129 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674313 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2215  HEPN domain-containing protein  36.08 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0357177  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4128  HEPN domain-containing protein  31.03 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000124069 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1045  HEPN domain-containing protein  41.86 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>