30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1958 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1958  HEPN domain-containing protein  100 
 
 
128 aa  264  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.704012  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0217  HEPN  42.62 
 
 
133 aa  102  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121698  hitchhiker  0.00000000000000140907 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3847  HEPN domain-containing protein  37.6 
 
 
127 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000584518  unclonable  0.00000679911 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0575  HEPN domain-containing protein  37.01 
 
 
131 aa  71.2  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.973071  normal  0.183085 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2146  HEPN domain protein  37.93 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2346  HEPN domain-containing protein  38.98 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048246  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3040  HEPN domain-containing protein  39.47 
 
 
132 aa  63.5  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0237  HEPN domain-containing protein  34.34 
 
 
131 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1919  HEPN domain-containing protein  36.84 
 
 
127 aa  57  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000391131 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0573  HEPN domain-containing protein  34.13 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168783  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2668  HEPN domain protein  34.45 
 
 
137 aa  55.1  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3437  HEPN domain-containing protein  46.3 
 
 
110 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.216023 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1620  HEPN domain-containing protein  38 
 
 
128 aa  51.2  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.24552  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3921  HEPN domain-containing protein  35.11 
 
 
127 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.063981 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0034  hypothetical protein  29.47 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0075  HepN domain protein  29.57 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.535733  normal  0.629451 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0039  HepN domain protein  38.33 
 
 
137 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108662 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0103  hypothetical protein  38.33 
 
 
137 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120432  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1576  HEPN  31.58 
 
 
132 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000021499  normal  0.0817706 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1027  HEPN domain-containing protein  42.37 
 
 
130 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.19731  normal  0.490071 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0062  HepN domain protein  38.33 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1451  HEPN domain-containing protein  40 
 
 
133 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.381216 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2469  HEPN domain-containing protein  30.84 
 
 
120 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.251161  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0171  HEPN domain-containing protein  31.52 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1698  HEPN domain-containing protein  31.75 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000156431  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1302  HEPN domain-containing protein  30.08 
 
 
136 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.260484  normal  0.456574 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2192  HEPN domain-containing protein  31.31 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.208434  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1131  HEPN domain-containing protein  31.01 
 
 
129 aa  40.8  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0366  HEPN domain-containing protein  30.53 
 
 
133 aa  40  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.205262 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1027  HEPN domain protein  27.05 
 
 
131 aa  40  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000217763  normal  0.602077 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>