15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1656 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1656  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  635    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290456  normal  0.0368168 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2824  hypothetical protein  75 
 
 		 320 aa  493  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0939  hypothetical protein  37.01 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4396  hypothetical protein  37.93 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1875  hypothetical protein  25.51 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2932  hypothetical protein  33.08 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1892  hypothetical protein  34.62 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00075804  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5394  hypothetical protein  36.22 
 
 		 195 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2257  hypothetical protein  36.97 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.15426  hitchhiker  0.00156511 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1021  hypothetical protein  35.24 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3810  hypothetical protein  36 
 
 		 226 aa  52.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.173804  normal  0.215522 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  51.35 
 
 		 1139 aa  46.6  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  38.6 
 
 		 788 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  37.88 
 
 		 747 aa  43.1  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4110  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.12 
 
 		 753 aa  42.7  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.61298 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>