14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2932 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2932  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  472  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4396  hypothetical protein  50.78 
 
 		 208 aa  182  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5394  hypothetical protein  55.62 
 
 		 195 aa  174  9e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1892  hypothetical protein  49.17 
 
 		 295 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00075804  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0939  hypothetical protein  50.9 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2257  hypothetical protein  49.51 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.15426  hitchhiker  0.00156511 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3810  hypothetical protein  49.17 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.173804  normal  0.215522 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1021  hypothetical protein  30.64 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2824  hypothetical protein  33.85 
 
 		 320 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1656  hypothetical protein  35.65 
 
 		 320 aa  72  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290456  normal  0.0368168 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26670  hypothetical protein  28.96 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.31967 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0805  hypothetical protein  24.14 
 
 		 182 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.302126 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3655  hypothetical protein  25.62 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208596 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1875  hypothetical protein  25.73 
 
 		 293 aa  42.7  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>