12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3810 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3810  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  442  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.173804  normal  0.215522 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1892  hypothetical protein  52.94 
 
 
295 aa  193  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00075804  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0939  hypothetical protein  53.07 
 
 
230 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5394  hypothetical protein  53.11 
 
 
195 aa  172  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4396  hypothetical protein  47.98 
 
 
208 aa  168  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2932  hypothetical protein  49.17 
 
 
241 aa  165  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2257  hypothetical protein  50.98 
 
 
215 aa  156  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.15426  hitchhiker  0.00156511 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1656  hypothetical protein  36.21 
 
 
320 aa  73.6  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290456  normal  0.0368168 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1021  hypothetical protein  30.94 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2824  hypothetical protein  34.4 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26670  hypothetical protein  29.07 
 
 
216 aa  54.3  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.31967 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1875  hypothetical protein  26.03 
 
 
293 aa  45.8  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>