14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5394 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5394  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  386  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1892  hypothetical protein  67.01 
 
 		 295 aa  264  5.999999999999999e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00075804  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0939  hypothetical protein  67.4 
 
 		 230 aa  238  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4396  hypothetical protein  59.89 
 
 		 208 aa  211  7e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2257  hypothetical protein  61.9 
 
 		 215 aa  196  3e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.15426  hitchhiker  0.00156511 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2932  hypothetical protein  55.62 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3810  hypothetical protein  53.11 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.173804  normal  0.215522 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1021  hypothetical protein  33.33 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2824  hypothetical protein  37.01 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1656  hypothetical protein  37.93 
 
 		 320 aa  72.8  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290456  normal  0.0368168 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26670  hypothetical protein  35.04 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.31967 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1875  hypothetical protein  28.57 
 
 		 293 aa  52.4  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0805  hypothetical protein  25.97 
 
 		 182 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.302126 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3655  hypothetical protein  25.14 
 
 		 252 aa  43.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208596 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>