12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4396 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4396  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  410  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1892  hypothetical protein  57.46 
 
 
295 aa  208  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00075804  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0939  hypothetical protein  51.35 
 
 
230 aa  201  8e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5394  hypothetical protein  59.89 
 
 
195 aa  201  8e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2932  hypothetical protein  50.78 
 
 
241 aa  182  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2257  hypothetical protein  55.25 
 
 
215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.15426  hitchhiker  0.00156511 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3810  hypothetical protein  47.98 
 
 
226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.173804  normal  0.215522 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1021  hypothetical protein  34.94 
 
 
200 aa  94  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1656  hypothetical protein  37.93 
 
 
320 aa  76.3  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290456  normal  0.0368168 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2824  hypothetical protein  33.56 
 
 
320 aa  72  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26670  hypothetical protein  30.12 
 
 
216 aa  58.2  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.31967 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0805  hypothetical protein  27.96 
 
 
182 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.302126 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>