12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1892 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1892  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00075804  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0939  hypothetical protein  71.2 
 
 
230 aa  278  7e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5394  hypothetical protein  70.79 
 
 
195 aa  253  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4396  hypothetical protein  57.46 
 
 
208 aa  209  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2257  hypothetical protein  60.51 
 
 
215 aa  206  5e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.15426  hitchhiker  0.00156511 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2932  hypothetical protein  49.17 
 
 
241 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3810  hypothetical protein  52.94 
 
 
226 aa  159  7e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.173804  normal  0.215522 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1021  hypothetical protein  28.92 
 
 
200 aa  79.7  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1656  hypothetical protein  36.44 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290456  normal  0.0368168 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2824  hypothetical protein  31.58 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0805  hypothetical protein  29.31 
 
 
182 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.302126 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26670  hypothetical protein  24.86 
 
 
216 aa  44.3  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.31967 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>