11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1021 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1021  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  402  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26670  hypothetical protein  33.68 
 
 
216 aa  104  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.31967 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0939  hypothetical protein  33.15 
 
 
230 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4396  hypothetical protein  34.94 
 
 
208 aa  94  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1892  hypothetical protein  28.24 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00075804  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2932  hypothetical protein  30.64 
 
 
241 aa  79  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5394  hypothetical protein  33.33 
 
 
195 aa  74.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2824  hypothetical protein  38.38 
 
 
320 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2257  hypothetical protein  28.81 
 
 
215 aa  64.7  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.15426  hitchhiker  0.00156511 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1656  hypothetical protein  35.35 
 
 
320 aa  55.5  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290456  normal  0.0368168 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3810  hypothetical protein  30.94 
 
 
226 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.173804  normal  0.215522 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>