27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1233 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1233  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  513  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.290144  normal  0.0670093 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1340  hypothetical protein  56.14 
 
 		 281 aa  271  5.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1595  hypothetical protein  53.81 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.371435  normal  0.0288718 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1923  hypothetical protein  51.74 
 
 		 254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0299755 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1624  hypothetical protein  49.37 
 
 		 253 aa  150  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2172  putative lipoprotein  48.4 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1088  putative lipoprotein  48.4 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12387  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0079  putative lipoprotein  48.4 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401581  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1817  putative lipoprotein  48.4 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1328  putative lipoprotein  48.4 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.25131  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2338  hypothetical protein  47.87 
 
 		 262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2209  putative lipoprotein  47.87 
 
 		 249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2526  conserved hypothetical lipoprotein  37.87 
 
 		 315 aa  125  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0092421  hitchhiker  0.00000000567204 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1477  hypothetical protein  47.54 
 
 		 249 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.113339 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1610  lipoprotein  37.44 
 
 		 312 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270701  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6282  hypothetical protein  46.99 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.833258  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1797  hypothetical protein  46.99 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2249  putative lipoprotein  44.89 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.413107  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1821  hypothetical protein  40.25 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.583376  normal  0.428024 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5098  hypothetical protein  45.45 
 
 		 250 aa  105  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1735  hypothetical protein  45.45 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1708  hypothetical protein  44.89 
 
 		 250 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.383188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1405  lipoprotein  35.41 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0101459  hitchhiker  0.00000142725 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0496  hypothetical protein  29.94 
 
 		 169 aa  64.3  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.696759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3497  hypothetical protein  38.89 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.935868  normal  0.99026 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1462  hypothetical protein  25 
 
 		 169 aa  47.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.811915  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2175  hypothetical protein  31.46 
 
 		 223 aa  43.5  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>