27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2526 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2526  conserved hypothetical lipoprotein  100 
 
 
315 aa  617  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0092421  hitchhiker  0.00000000567204 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1610  lipoprotein  85.08 
 
 
312 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270701  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1405  lipoprotein  75.6 
 
 
280 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0101459  hitchhiker  0.00000142725 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2172  putative lipoprotein  54.38 
 
 
248 aa  178  8e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1328  putative lipoprotein  54.38 
 
 
249 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.25131  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1088  putative lipoprotein  54.38 
 
 
249 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12387  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0079  putative lipoprotein  54.38 
 
 
249 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401581  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1817  putative lipoprotein  54.38 
 
 
249 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2338  hypothetical protein  54.38 
 
 
262 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2209  putative lipoprotein  53.92 
 
 
249 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1477  hypothetical protein  55.56 
 
 
249 aa  176  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.113339 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1797  hypothetical protein  53.6 
 
 
250 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6282  hypothetical protein  53.6 
 
 
250 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.833258  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1821  hypothetical protein  54.35 
 
 
250 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.583376  normal  0.428024 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2249  putative lipoprotein  50.72 
 
 
252 aa  158  9e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.413107  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1735  hypothetical protein  54.33 
 
 
250 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1708  hypothetical protein  54.33 
 
 
250 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.383188  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5098  hypothetical protein  53.85 
 
 
250 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1233  hypothetical protein  39.25 
 
 
258 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.290144  normal  0.0670093 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1340  hypothetical protein  36.19 
 
 
281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1595  hypothetical protein  37.38 
 
 
254 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.371435  normal  0.0288718 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1624  hypothetical protein  49.56 
 
 
253 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871693  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1923  hypothetical protein  34.34 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0299755 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0496  hypothetical protein  38.21 
 
 
169 aa  63.9  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.696759  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1462  hypothetical protein  37.38 
 
 
169 aa  51.2  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.811915  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3244  hypothetical protein  31.54 
 
 
250 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347106  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3497  hypothetical protein  35.21 
 
 
242 aa  43.1  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.935868  normal  0.99026 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>