21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1462 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1462  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  337  5e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.811915  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0496  hypothetical protein  78.7 
 
 		 169 aa  272  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.696759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1610  lipoprotein  31.08 
 
 		 312 aa  53.9  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270701  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2526  conserved hypothetical lipoprotein  34.15 
 
 		 315 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0092421  hitchhiker  0.00000000567204 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1405  lipoprotein  35.4 
 
 		 280 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0101459  hitchhiker  0.00000142725 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1923  hypothetical protein  25.14 
 
 		 254 aa  47.8  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0299755 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1340  hypothetical protein  30 
 
 		 281 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1595  hypothetical protein  24.58 
 
 		 254 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.371435  normal  0.0288718 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1233  hypothetical protein  31.25 
 
 		 258 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.290144  normal  0.0670093 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5098  hypothetical protein  35.71 
 
 		 250 aa  44.3  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2172  putative lipoprotein  33.93 
 
 		 248 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1088  putative lipoprotein  33.93 
 
 		 249 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2209  putative lipoprotein  34.58 
 
 		 249 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0079  putative lipoprotein  33.93 
 
 		 249 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401581  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1817  putative lipoprotein  33.93 
 
 		 249 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2338  hypothetical protein  33.93 
 
 		 262 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1328  putative lipoprotein  33.93 
 
 		 249 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.25131  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1624  hypothetical protein  33.33 
 
 		 253 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1477  hypothetical protein  35.51 
 
 		 249 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.113339 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2175  hypothetical protein  31.62 
 
 		 223 aa  42.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2249  putative lipoprotein  32.46 
 
 		 252 aa  42  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.413107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>