13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2175 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2175  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  429  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2620  hypothetical protein  35.59 
 
 		 215 aa  98.2  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3244  hypothetical protein  37.27 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1826  hypothetical protein  34.07 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.887746  normal  0.758724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3497  hypothetical protein  43.59 
 
 		 242 aa  58.2  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.935868  normal  0.99026 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1902  hypothetical protein  34.07 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0496  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  50.8  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.696759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1923  hypothetical protein  30.53 
 
 		 254 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0299755 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1340  hypothetical protein  29.09 
 
 		 281 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1595  hypothetical protein  28.33 
 
 		 254 aa  45.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.371435  normal  0.0288718 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1462  hypothetical protein  29.14 
 
 		 169 aa  43.1  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.811915  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1233  hypothetical protein  30.73 
 
 		 258 aa  42  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.290144  normal  0.0670093 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2338  hypothetical protein  29.84 
 
 		 262 aa  42  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>