30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1624 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1624  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  504  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1595  hypothetical protein  74.78 
 
 		 254 aa  296  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.371435  normal  0.0288718 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1923  hypothetical protein  76.39 
 
 		 254 aa  278  5e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0299755 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1340  hypothetical protein  54.59 
 
 		 281 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1233  hypothetical protein  54.31 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.290144  normal  0.0670093 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1477  hypothetical protein  50 
 
 		 249 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.113339 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2526  conserved hypothetical lipoprotein  37.71 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0092421  hitchhiker  0.00000000567204 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2172  putative lipoprotein  45.56 
 
 		 248 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1088  putative lipoprotein  45.56 
 
 		 249 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12387  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0079  putative lipoprotein  45.56 
 
 		 249 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401581  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1817  putative lipoprotein  45.56 
 
 		 249 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1328  putative lipoprotein  45.56 
 
 		 249 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.25131  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2338  hypothetical protein  45.56 
 
 		 262 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2209  putative lipoprotein  45 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6282  hypothetical protein  42.23 
 
 		 250 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.833258  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1797  hypothetical protein  42.23 
 
 		 250 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1610  lipoprotein  34.65 
 
 		 312 aa  108  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270701  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1821  hypothetical protein  46.02 
 
 		 250 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.583376  normal  0.428024 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1735  hypothetical protein  46.02 
 
 		 250 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1708  hypothetical protein  45.45 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.383188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1405  lipoprotein  37.02 
 
 		 280 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0101459  hitchhiker  0.00000142725 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2249  putative lipoprotein  46.88 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.413107  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5098  hypothetical protein  44.89 
 
 		 250 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1462  hypothetical protein  28.24 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.811915  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0496  hypothetical protein  32.5 
 
 		 169 aa  54.3  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.696759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  26.75 
 
 		 2196 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  27.42 
 
 		 3242 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2175  hypothetical protein  27.5 
 
 		 223 aa  48.9  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5536  collagen adhesion protein  27.35 
 
 		 3392 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2008  hypothetical protein  39.29 
 
 		 204 aa  42.4  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.276921 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>