28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6282 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_1797  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  484  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6282  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  484  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.833258  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1821  hypothetical protein  98.4 
 
 
250 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.583376  normal  0.428024 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1477  hypothetical protein  83.54 
 
 
249 aa  295  4e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.113339 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1708  hypothetical protein  91.88 
 
 
250 aa  295  5e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.383188  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1735  hypothetical protein  91.45 
 
 
250 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5098  hypothetical protein  92.31 
 
 
250 aa  291  8e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1328  putative lipoprotein  68.67 
 
 
249 aa  260  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.25131  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1088  putative lipoprotein  68.67 
 
 
249 aa  260  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12387  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0079  putative lipoprotein  68.67 
 
 
249 aa  260  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401581  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1817  putative lipoprotein  68.67 
 
 
249 aa  260  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2209  putative lipoprotein  68.27 
 
 
249 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2338  hypothetical protein  68.67 
 
 
262 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2172  putative lipoprotein  68.55 
 
 
248 aa  259  4e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1610  lipoprotein  57.14 
 
 
312 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270701  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2249  putative lipoprotein  66.67 
 
 
252 aa  232  5e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.413107  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2526  conserved hypothetical lipoprotein  54.17 
 
 
315 aa  221  9e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0092421  hitchhiker  0.00000000567204 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1405  lipoprotein  58.65 
 
 
280 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0101459  hitchhiker  0.00000142725 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1233  hypothetical protein  46.88 
 
 
258 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.290144  normal  0.0670093 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1340  hypothetical protein  39.34 
 
 
281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1595  hypothetical protein  41.03 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.371435  normal  0.0288718 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1624  hypothetical protein  41.15 
 
 
253 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871693  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1923  hypothetical protein  42.74 
 
 
254 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0299755 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0496  hypothetical protein  32 
 
 
169 aa  61.2  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.696759  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1462  hypothetical protein  30.97 
 
 
169 aa  53.9  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.811915  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3497  hypothetical protein  40.3 
 
 
242 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.935868  normal  0.99026 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3244  hypothetical protein  38.1 
 
 
250 aa  44.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347106  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2620  hypothetical protein  41.46 
 
 
215 aa  42.7  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261355  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>