26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_2209 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_2209  putative lipoprotein  100 
 
 
249 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1328  putative lipoprotein  99.6 
 
 
249 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.25131  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1088  putative lipoprotein  99.6 
 
 
249 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12387  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2172  putative lipoprotein  99.6 
 
 
248 aa  477  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0079  putative lipoprotein  99.6 
 
 
249 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401581  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1817  putative lipoprotein  99.6 
 
 
249 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2338  hypothetical protein  99.2 
 
 
262 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2249  putative lipoprotein  85.29 
 
 
252 aa  295  6e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.413107  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1477  hypothetical protein  68.85 
 
 
249 aa  248  5e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.113339 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6282  hypothetical protein  66.94 
 
 
250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.833258  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1797  hypothetical protein  66.94 
 
 
250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1821  hypothetical protein  66.53 
 
 
250 aa  225  6e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.583376  normal  0.428024 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1735  hypothetical protein  67.23 
 
 
250 aa  221  6e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1708  hypothetical protein  66.81 
 
 
250 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.383188  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5098  hypothetical protein  67.23 
 
 
250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1610  lipoprotein  53.33 
 
 
312 aa  214  8e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270701  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2526  conserved hypothetical lipoprotein  50.83 
 
 
315 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0092421  hitchhiker  0.00000000567204 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1405  lipoprotein  54.55 
 
 
280 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0101459  hitchhiker  0.00000142725 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1233  hypothetical protein  47.87 
 
 
258 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.290144  normal  0.0670093 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1340  hypothetical protein  37.6 
 
 
281 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1595  hypothetical protein  39.17 
 
 
254 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.371435  normal  0.0288718 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1624  hypothetical protein  43.23 
 
 
253 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871693  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1923  hypothetical protein  38.71 
 
 
254 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0299755 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0496  hypothetical protein  34.58 
 
 
169 aa  52.8  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.696759  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1462  hypothetical protein  29.24 
 
 
169 aa  49.7  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.811915  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2175  hypothetical protein  34.95 
 
 
223 aa  46.2  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>