More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1433 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1433  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  100 
 
 
327 aa  645    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.293443  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2625  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.97 
 
 
325 aa  219  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000950552  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4534  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.96 
 
 
328 aa  219  7e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0891717  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2861  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.19 
 
 
329 aa  218  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1699  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.54 
 
 
326 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.440081  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3647  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.51 
 
 
329 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4350  electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.35 
 
 
325 aa  211  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.233822  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4649  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.03 
 
 
325 aa  210  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4418  electron transfer flavoprotein subunit alpha  39.03 
 
 
325 aa  210  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4257  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.03 
 
 
325 aa  210  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4269  electron transfer flavoprotein, alpha subunit (alpha-ETF)  39.03 
 
 
325 aa  210  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4759  electron transfer flavoprotein subunit alpha  39.03 
 
 
325 aa  210  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4634  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.03 
 
 
325 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4650  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.03 
 
 
325 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4630  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.03 
 
 
325 aa  208  8e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0583219  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3222  electron transfer flavoprotein alpha subunit  40 
 
 
325 aa  208  9e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0605  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.03 
 
 
325 aa  208  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0831  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40 
 
 
325 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1779  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.99 
 
 
325 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0107  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.37 
 
 
329 aa  204  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.281869 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0059  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  39.42 
 
 
341 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122913 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1879  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.64 
 
 
410 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.281207  normal  0.354147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1075  electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.41 
 
 
320 aa  199  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13044  electron transfer flavoprotein alpha subunit fixB  42.24 
 
 
318 aa  198  9e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00188433  hitchhiker  0.00116016 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2355  Electron transfer flavoprotein subunit alpha  41.55 
 
 
315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2257  electron transfer flavoprotein subunit alpha  35.08 
 
 
442 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00336089  hitchhiker  0.0000000000804212 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3165  electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.69 
 
 
317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2927  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.5 
 
 
452 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1354  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.51 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00167442  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1358  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.19 
 
 
452 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1484  electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.92 
 
 
397 aa  194  1e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11518  normal  0.562863 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2132  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.28 
 
 
436 aa  194  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000989021 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0368  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.42 
 
 
338 aa  193  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2415  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.82 
 
 
441 aa  193  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2796  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.57 
 
 
340 aa  192  7e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2582  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  34.49 
 
 
335 aa  192  7e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2284  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  34.49 
 
 
335 aa  192  7e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.383741  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4091  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.26 
 
 
320 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0065  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.97 
 
 
320 aa  188  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.777154  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0050  electron transfer flavoprotein alpha and beta subunits  41.21 
 
 
320 aa  188  9e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.69565 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3259  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.22 
 
 
317 aa  187  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2786  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.85 
 
 
447 aa  187  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2066  electron transfer flavoprotein subunit alpha  33.44 
 
 
448 aa  187  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0571  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.44 
 
 
443 aa  186  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.871139  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0684  electron transfer flavoprotein subunit alpha  33.76 
 
 
443 aa  186  5e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0329544  normal  0.845757 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0697  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.64 
 
 
317 aa  186  6e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0053  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.67 
 
 
320 aa  185  7e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1212  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.82 
 
 
441 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.72306  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1373  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.79 
 
 
399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.255821  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0635  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.82 
 
 
610 aa  183  3e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3535  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1467  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.85 
 
 
447 aa  184  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0049  electron transfer flavoprotein alpha and beta subunits  40.51 
 
 
321 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0583  electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.63 
 
 
341 aa  183  3e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0411  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.91 
 
 
325 aa  183  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1544  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  33.66 
 
 
339 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1607  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.54 
 
 
399 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1851  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.18 
 
 
318 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.404972  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2715  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.01 
 
 
439 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777462 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1871  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.18 
 
 
318 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1917  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.18 
 
 
318 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0811412  normal  0.638543 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2916  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.54 
 
 
318 aa  182  7e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113103  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1857  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.75 
 
 
330 aa  182  8.000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.519797  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1269  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.62 
 
 
316 aa  181  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.877633 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1936  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  34.29 
 
 
441 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.993938  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2845  electron transfer flavoprotein subunit alpha  38.04 
 
 
317 aa  181  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1590  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.86 
 
 
327 aa  182  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10530  electron transfer flavoprotein, alpha subunit, FixB  36.01 
 
 
360 aa  181  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291846  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1369  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  34.63 
 
 
374 aa  181  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28250  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.57 
 
 
319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1836  electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.47 
 
 
325 aa  179  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0730508  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3658  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.39 
 
 
320 aa  179  7e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1501  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.37 
 
 
442 aa  179  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2086  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.46 
 
 
436 aa  179  8e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0985  electron transfer flavoprotein subunit alpha  41.03 
 
 
312 aa  178  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3332  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.39 
 
 
317 aa  178  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3825  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.01 
 
 
317 aa  178  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.194441  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1539  electron transfer flavoprotein beta-subunit  34.74 
 
 
439 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.345257  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3700  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.37 
 
 
327 aa  177  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0768904  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1248  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  30.63 
 
 
601 aa  177  3e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2298  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.02 
 
 
328 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0954  electron transfer flavoprotein subunit alpha  40.66 
 
 
312 aa  176  4e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3167  electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.69 
 
 
328 aa  176  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144656  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0594  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.36 
 
 
313 aa  176  6e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0386  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.08 
 
 
315 aa  175  8e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4258  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.34 
 
 
318 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2741  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  40.06 
 
 
317 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1104  electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.58 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.217236  normal  0.0210631 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09610  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.19 
 
 
317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0631029  normal  0.104642 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0131  electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.22 
 
 
333 aa  173  3.9999999999999995e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1211  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  40.13 
 
 
319 aa  172  6.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1078  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.66 
 
 
335 aa  171  2e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.224584 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1435  electron transfer flavoprotein fixB (alpha subunit)  34.74 
 
 
367 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000130268  normal  0.0153048 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7738  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  34.97 
 
 
374 aa  170  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0342501  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1816  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.27 
 
 
317 aa  169  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378347  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0257  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.69 
 
 
314 aa  170  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.589105  normal  0.147331 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3159  electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.7 
 
 
309 aa  170  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1388  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.16 
 
 
317 aa  169  5e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1479  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.1 
 
 
364 aa  168  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0999  electron transfer flavoprotein subunit alpha  39.7 
 
 
315 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1195  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.1 
 
 
364 aa  168  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.028424 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>