282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4428 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4428  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
447 aa  909    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4114  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  97.32 
 
 
447 aa  863    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0284  ABC transporter membrane spanning protein (phosphonate)  51.81 
 
 
499 aa  466  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4665  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  51.1 
 
 
503 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608536 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4784  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.89 
 
 
441 aa  241  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0495045  normal  0.124049 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3706  phosphonate ABC transporter permease  36.95 
 
 
439 aa  236  8e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.344193 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1319  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  46.39 
 
 
287 aa  178  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758207  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2680  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  42.86 
 
 
298 aa  172  7.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1413  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  43.81 
 
 
299 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2875  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  42.38 
 
 
293 aa  169  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1342  phosphonate ABC transporter permease  42.38 
 
 
293 aa  169  9e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2796  phosphonate ABC transporter, permease protein  41.9 
 
 
293 aa  169  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4086  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  40.09 
 
 
293 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0261465  normal  0.0836049 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0766  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.91 
 
 
293 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688417  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4087  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  44.08 
 
 
288 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0914219  normal  0.0810943 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0765  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  45.02 
 
 
288 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.460298  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5856  putative PhnE protein, phosphonate ABC transporter, putative membrane protein  39.91 
 
 
294 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234805  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2918  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41.79 
 
 
294 aa  156  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1320  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41.23 
 
 
294 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0459  ABC type permease  43.56 
 
 
261 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110388  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0423  ABC type permease  43.56 
 
 
261 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.436548  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1322  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41.86 
 
 
300 aa  155  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4204  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  45.71 
 
 
288 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194817  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0897  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.53 
 
 
298 aa  152  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.223328  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2888  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.3 
 
 
263 aa  151  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117638  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3257  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.93 
 
 
272 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.814913  normal  0.191415 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2185  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.33 
 
 
290 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4430  phosphonate ABC transporter permease  38.79 
 
 
293 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.2 
 
 
277 aa  150  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.482347 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3857  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.2 
 
 
277 aa  150  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0307  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.71 
 
 
259 aa  149  8e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.685305  normal  0.115805 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2184  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  45.59 
 
 
290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.122688  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6089  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41.75 
 
 
270 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5616  phosphonate ABC transporter, permease protein  38.24 
 
 
259 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03975  phosphonate/organophosphate ester transporter  38.24 
 
 
272 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4344  phosphonate ABC transporter, permease protein  38.24 
 
 
259 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4657  phosphonate ABC transporter, permease protein  38.24 
 
 
259 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4605  phosphonate ABC transporter, permease protein  36.65 
 
 
259 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4569  phosphonate ABC transporter, permease protein  38.24 
 
 
259 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2966  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.78 
 
 
266 aa  148  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2914  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41.87 
 
 
269 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263053  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3923  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.24 
 
 
259 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3302  phosphonate ABC transporter, permease protein  36.63 
 
 
271 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314465  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3370  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.46 
 
 
267 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000747615  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3348  phosphonates ABC transporter, permease protein  36.63 
 
 
271 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3336  phosphonate ABC transporter, permease protein  36.63 
 
 
271 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3823  phosphonate ABC transporter permease  44.1 
 
 
282 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.378202  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3859  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  44.71 
 
 
288 aa  145  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199616  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4203  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41.5 
 
 
294 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.852389  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3792  phosphonate ABC transporter, permease protein  38.46 
 
 
267 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4036  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.1 
 
 
341 aa  144  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.311979  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0216  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.1 
 
 
341 aa  144  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3472  phosphonate ABC transporter permease  38.03 
 
 
267 aa  144  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.153404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3438  phosphonate ABC transporter, permease  38.03 
 
 
267 aa  144  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.573649  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3389  phosphonate ABC transporter, permease  38.03 
 
 
267 aa  144  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00227176  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3747  phosphonate ABC transporter permease  38.03 
 
 
267 aa  144  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.375049  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3701  phosphonate ABC transporter, permease protein  38.03 
 
 
267 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177586 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1523  phosphonate ABC transporter, permease protein  38.46 
 
 
267 aa  144  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137606  normal  0.0137345 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3743  phosphonate ABC transporter, permease protein  38.03 
 
 
267 aa  143  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000033324  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5855  putative PhnE protein, phosphonate ABC transporter, putative membrane protein  44.16 
 
 
282 aa  144  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0463216  normal  0.82281 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4429  phosphonate ABC transporter permease  43.59 
 
 
282 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3236  phosphonate ABC transporter permease  36.44 
 
 
276 aa  143  5e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2409  phosphonates ABC transporter, permease protein  36.14 
 
 
271 aa  143  7e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0326  phosphonates ABC transporter, permease protein  36.14 
 
 
271 aa  143  7e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1187  phosphonates ABC transporter, permease protein  36.14 
 
 
271 aa  143  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2596  phosphonates ABC transporter, permease protein  36.14 
 
 
271 aa  143  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4577  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.91 
 
 
271 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3720  phosphonate ABC transporter, permease protein  38.03 
 
 
267 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0181873  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3822  phosphonate ABC transporter permease  40.85 
 
 
300 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571251  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2675  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.38 
 
 
297 aa  142  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0563966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1747  phosphonate ABC transporter permease PhnE  42.86 
 
 
264 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.415612  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20330  phosphonate ABC tranporter permease protein  42.86 
 
 
264 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.293398  normal  0.582568 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1925  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  40.49 
 
 
272 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.77597  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3965  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41.24 
 
 
272 aa  140  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.692533 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0183  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  42.6 
 
 
267 aa  140  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685184  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0250  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  42.27 
 
 
277 aa  139  7e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3860  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  43 
 
 
293 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.206995  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2012  putative ABC transporter inner membrane component  39.53 
 
 
271 aa  139  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100736  decreased coverage  0.00339933 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2249  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.47 
 
 
262 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.859646  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2557  phosphonates ABC transporter, permease protein  39.47 
 
 
262 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108995  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0261  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.66 
 
 
271 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0745614 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0837  ABC phosphonate transporter, inner membrane subunit PhnE  38.86 
 
 
280 aa  137  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0879001 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3240  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.78 
 
 
276 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.655899  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2202  phosphonate ABC transporter inner membrane subunit  43.56 
 
 
542 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4522  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.95 
 
 
280 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3991  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.78 
 
 
276 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608155  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0182  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  43.56 
 
 
542 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4621  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.76 
 
 
280 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.438003 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1280  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.78 
 
 
276 aa  134  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.61484  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3693  ABC phosphonate transporter inner membrane protein  34.69 
 
 
335 aa  134  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2337  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.18 
 
 
268 aa  134  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000326587  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2081  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  32.27 
 
 
335 aa  133  6e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1418  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.44 
 
 
266 aa  132  9e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2917  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  48.98 
 
 
286 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2298  ABC phosphonate permease  36.08 
 
 
271 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1522  phosphonate ABC transporter, permease protein  37.93 
 
 
264 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0252842  normal  0.0146163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4995  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.85 
 
 
245 aa  130  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.250762  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6356  phosphonate ABC transporter, permease protein  40.1 
 
 
298 aa  130  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.690717  normal  0.762824 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5875  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  32.77 
 
 
277 aa  130  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3721  phosphonate ABC transporter, permease protein  37.93 
 
 
264 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.254444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>