260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2917 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2917  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
286 aa  546  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4204  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  84.07 
 
 
288 aa  411  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194817  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3859  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  79.15 
 
 
288 aa  365  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199616  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1319  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  58.78 
 
 
287 aa  299  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758207  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2184  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  59.23 
 
 
290 aa  298  7e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.122688  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5855  putative PhnE protein, phosphonate ABC transporter, putative membrane protein  60.73 
 
 
282 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0463216  normal  0.82281 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3823  phosphonate ABC transporter permease  61.9 
 
 
282 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.378202  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4429  phosphonate ABC transporter permease  60.15 
 
 
282 aa  279  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0765  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  57.8 
 
 
288 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.460298  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4087  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  55.67 
 
 
288 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0914219  normal  0.0810943 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1413  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.49 
 
 
299 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2680  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.93 
 
 
298 aa  167  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2914  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.67 
 
 
269 aa  167  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263053  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2966  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.35 
 
 
266 aa  166  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2796  phosphonate ABC transporter, permease protein  45.05 
 
 
293 aa  165  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1342  phosphonate ABC transporter permease  45.54 
 
 
293 aa  166  5.9999999999999996e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3348  phosphonates ABC transporter, permease protein  42.79 
 
 
271 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3336  phosphonate ABC transporter, permease protein  42.79 
 
 
271 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3302  phosphonate ABC transporter, permease protein  42.79 
 
 
271 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314465  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2875  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  45.05 
 
 
293 aa  165  9e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03975  phosphonate/organophosphate ester transporter  39.73 
 
 
272 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3923  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.73 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6089  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.47 
 
 
270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4344  phosphonate ABC transporter, permease protein  39.73 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2888  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41.67 
 
 
263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117638  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0284  ABC transporter membrane spanning protein (phosphonate)  51.46 
 
 
499 aa  164  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4569  phosphonate ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4657  phosphonate ABC transporter, permease protein  39.73 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.59 
 
 
277 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.482347 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3257  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  42.24 
 
 
272 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.814913  normal  0.191415 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3857  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.59 
 
 
277 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1187  phosphonates ABC transporter, permease protein  42.36 
 
 
271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5616  phosphonate ABC transporter, permease protein  39.73 
 
 
259 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2409  phosphonates ABC transporter, permease protein  42.36 
 
 
271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0326  phosphonates ABC transporter, permease protein  42.36 
 
 
271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0307  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.22 
 
 
259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.685305  normal  0.115805 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2596  phosphonates ABC transporter, permease protein  42.36 
 
 
271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4605  phosphonate ABC transporter, permease protein  39.29 
 
 
259 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4621  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  42.98 
 
 
280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.438003 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5856  putative PhnE protein, phosphonate ABC transporter, putative membrane protein  43.78 
 
 
294 aa  159  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234805  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3706  phosphonate ABC transporter permease  47.94 
 
 
439 aa  158  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.344193 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4522  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.08 
 
 
280 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4665  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  48.08 
 
 
503 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608536 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4784  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  46.94 
 
 
441 aa  155  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0495045  normal  0.124049 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4428  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  48.74 
 
 
447 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0897  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.3 
 
 
298 aa  152  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.223328  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1322  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.27 
 
 
300 aa  152  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0837  ABC phosphonate transporter, inner membrane subunit PhnE  40.09 
 
 
280 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0879001 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4114  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  48.72 
 
 
447 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4151  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.84 
 
 
274 aa  149  7e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2287  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.84 
 
 
274 aa  149  7e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0773  phosphonate ABC transporter permease  38.35 
 
 
292 aa  148  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.741951  normal  0.989098 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0183  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  39.04 
 
 
267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685184  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20330  phosphonate ABC tranporter permease protein  42.34 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.293398  normal  0.582568 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2918  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  44.56 
 
 
294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1747  phosphonate ABC transporter permease PhnE  42.34 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.415612  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2185  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  44.44 
 
 
290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6356  phosphonate ABC transporter, permease protein  38.2 
 
 
298 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.690717  normal  0.762824 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4179  phosphonate ABC transporter permease  38.29 
 
 
288 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1320  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  42.64 
 
 
294 aa  147  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2249  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.3 
 
 
262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.859646  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3380  putative phosphonate transport system permease protein htxC phnE  40.26 
 
 
273 aa  145  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.590376  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2202  phosphonate ABC transporter inner membrane subunit  39.5 
 
 
542 aa  145  6e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0261  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.53 
 
 
271 aa  145  8.000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0745614 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4203  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  44.67 
 
 
294 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.852389  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0182  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.76 
 
 
542 aa  145  9e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0766  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  42.56 
 
 
293 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688417  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2557  phosphonates ABC transporter, permease protein  39.3 
 
 
262 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108995  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6365  phosphonate ABC transporter, permease component  39.73 
 
 
289 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0563067  normal  0.924702 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2298  ABC phosphonate permease  36.09 
 
 
271 aa  143  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4430  phosphonate ABC transporter permease  41 
 
 
293 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4086  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  40.51 
 
 
293 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0261465  normal  0.0836049 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3822  phosphonate ABC transporter permease  44.16 
 
 
300 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571251  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3991  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.61 
 
 
276 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608155  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3240  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.61 
 
 
276 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.655899  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0250  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  40.18 
 
 
277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1280  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.61 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.61484  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3693  ABC phosphonate transporter inner membrane protein  36.32 
 
 
335 aa  140  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2675  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.23 
 
 
297 aa  140  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0563966 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3965  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.72 
 
 
272 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.692533 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5875  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.39 
 
 
277 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0873  phosphonate ABC transporter inner membrane subunit  35.29 
 
 
265 aa  139  7e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.122179 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0827  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.78 
 
 
267 aa  137  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.152622  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0912  phosphate ABC transporter permease  33.94 
 
 
275 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.166132  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1322  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.95 
 
 
533 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497345  normal  0.731542 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4996  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.94 
 
 
264 aa  136  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0396446  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3326  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  37.67 
 
 
365 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2797  phosphonate ABC transporter, permease protein  38.54 
 
 
286 aa  135  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1343  phosphonate ABC transporter permease  38.54 
 
 
286 aa  135  7.000000000000001e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0495626 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2876  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.02 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0459  ABC type permease  40.5 
 
 
261 aa  134  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110388  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0423  ABC type permease  40.5 
 
 
261 aa  134  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.436548  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3390  phosphonate ABC transporter, permease  34.21 
 
 
264 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0936447  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3473  phosphonate ABC transporter permease  34.21 
 
 
264 aa  132  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3439  phosphonate ABC transporter, permease  34.21 
 
 
264 aa  132  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3702  phosphonate ABC transporter, permease protein  34.21 
 
 
264 aa  132  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000191718 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3748  phosphonate ABC transporter permease  34.21 
 
 
264 aa  132  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3860  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  43.15 
 
 
293 aa  132  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.206995  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4995  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.91 
 
 
245 aa  132  9e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.250762  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3371  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.78 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0022523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>