39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5093 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5093  flagellar protein FliT  100 
 
 
110 aa  219  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5256  putative flagellar protein FliT  42.73 
 
 
114 aa  94.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0330194 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0225  hypothetical protein  45.98 
 
 
108 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11841  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2139  hypothetical protein  45.98 
 
 
108 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0237  hypothetical protein  45.98 
 
 
108 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3397  hypothetical protein  45.98 
 
 
108 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2949  hypothetical protein  45.98 
 
 
108 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3284  hypothetical protein  45.98 
 
 
108 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2972  hypothetical protein  43.68 
 
 
110 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.10272  normal  0.124393 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3058  hypothetical protein  43.68 
 
 
110 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0203  hypothetical protein  43.68 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3106  hypothetical protein  42.53 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2447  hypothetical protein  40.23 
 
 
110 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120325  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3061  hypothetical protein  40.23 
 
 
110 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.151059  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3080  hypothetical protein  40.23 
 
 
110 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4747  putative flagellar protein FliT  36.54 
 
 
118 aa  67  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.408466 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3670  flagellar protein FliT  36.54 
 
 
118 aa  67  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643949  normal  0.821667 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6410  hypothetical protein  40.23 
 
 
110 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.172158 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2928  putative flagellar protein FliT  39.8 
 
 
109 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24270  flagellar protein  35.85 
 
 
127 aa  63.5  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0385  flagellar protein FliT  35.58 
 
 
118 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.691799  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0169  putative flagellar protein FliT  40.82 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.370668 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3767  putative flagellar protein FliT  39.8 
 
 
108 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.684453 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2863  flagellar chaperone  35.16 
 
 
99 aa  58.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1538  flagellar export chaperone  33.98 
 
 
124 aa  57.8  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.472804  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2897  hypothetical protein  36 
 
 
122 aa  57  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1013  flagellar chaperone  35.56 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0634  flagellar protein FliT  36.17 
 
 
99 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3139  hypothetical protein  34.62 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.529843  normal  0.437682 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2773  flagellar export chaperone  34.62 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.804206 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0621  flagellar protein FliT  35 
 
 
99 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3809  flagellar protein FliT  33.33 
 
 
99 aa  50.1  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3083  flagellar protein FliT  33.33 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.88004  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2031  hypothetical protein  30.84 
 
 
127 aa  48.9  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.29372  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1578  flagellar export chaperone  26.17 
 
 
120 aa  48.9  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4397  flagellar protein FliT  34.48 
 
 
99 aa  48.9  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1111  flagellar protein FliT  36.26 
 
 
98 aa  47.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1341  flagellar protein FliT  32.98 
 
 
113 aa  46.2  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0498438  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2573  flagellar biosynthesis protein FliT  22.73 
 
 
126 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.694894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>