35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3809 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3809  flagellar protein FliT  100 
 
 
99 aa  207  5e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3083  flagellar protein FliT  98.99 
 
 
99 aa  204  4e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.88004  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4397  flagellar protein FliT  80.81 
 
 
99 aa  169  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0621  flagellar protein FliT  77.78 
 
 
99 aa  164  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0634  flagellar protein FliT  68.69 
 
 
99 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1111  flagellar protein FliT  65.98 
 
 
98 aa  134  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2863  flagellar chaperone  52.53 
 
 
99 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1013  flagellar chaperone  54.35 
 
 
114 aa  105  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2897  hypothetical protein  38.46 
 
 
122 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5093  flagellar protein FliT  33.33 
 
 
110 aa  50.1  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1341  flagellar protein FliT  31.33 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0498438  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0169  putative flagellar protein FliT  35.63 
 
 
108 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.370668 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3139  hypothetical protein  35.56 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.529843  normal  0.437682 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2773  flagellar export chaperone  35.56 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.804206 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3767  putative flagellar protein FliT  34.48 
 
 
108 aa  47  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.684453 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2928  putative flagellar protein FliT  31.33 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1982  flagellar protein FliT  28.09 
 
 
113 aa  44.3  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0203  hypothetical protein  33.73 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2972  hypothetical protein  30.23 
 
 
110 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.10272  normal  0.124393 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4747  putative flagellar protein FliT  28.41 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.408466 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3670  flagellar protein FliT  28.41 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643949  normal  0.821667 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1594  flagellar protein FliT  28.24 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0385  flagellar protein FliT  29.76 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.691799  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3058  hypothetical protein  30.95 
 
 
110 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3106  hypothetical protein  30.23 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6410  hypothetical protein  30.23 
 
 
110 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.172158 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3080  hypothetical protein  30.23 
 
 
110 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3061  hypothetical protein  30.23 
 
 
110 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.151059  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2447  hypothetical protein  30.23 
 
 
110 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120325  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0237  hypothetical protein  32.53 
 
 
108 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3397  hypothetical protein  32.53 
 
 
108 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0225  hypothetical protein  32.53 
 
 
108 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11841  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2139  hypothetical protein  32.53 
 
 
108 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2949  hypothetical protein  32.53 
 
 
108 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3284  hypothetical protein  32.53 
 
 
108 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>