36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0621 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0621  flagellar protein FliT  100 
 
 
99 aa  207  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3809  flagellar protein FliT  77.78 
 
 
99 aa  164  5e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3083  flagellar protein FliT  80 
 
 
99 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.88004  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4397  flagellar protein FliT  68.69 
 
 
99 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0634  flagellar protein FliT  64.65 
 
 
99 aa  131  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1111  flagellar protein FliT  60 
 
 
98 aa  122  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2863  flagellar chaperone  46.46 
 
 
99 aa  102  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1013  flagellar chaperone  50 
 
 
114 aa  96.3  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1982  flagellar protein FliT  32.56 
 
 
113 aa  53.5  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2897  hypothetical protein  36.71 
 
 
122 aa  52.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5093  flagellar protein FliT  35 
 
 
110 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1341  flagellar protein FliT  29.07 
 
 
113 aa  51.2  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0498438  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1594  flagellar protein FliT  30.59 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3670  flagellar protein FliT  30.34 
 
 
118 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643949  normal  0.821667 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4747  putative flagellar protein FliT  30.34 
 
 
118 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.408466 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3058  hypothetical protein  30.95 
 
 
110 aa  47.8  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0385  flagellar protein FliT  31.46 
 
 
118 aa  47  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.691799  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0203  hypothetical protein  32.53 
 
 
108 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0169  putative flagellar protein FliT  33.33 
 
 
108 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.370668 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2972  hypothetical protein  31.82 
 
 
110 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.10272  normal  0.124393 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2773  flagellar export chaperone  33.68 
 
 
125 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.804206 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3139  hypothetical protein  33.68 
 
 
125 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.529843  normal  0.437682 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2928  putative flagellar protein FliT  30.12 
 
 
109 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3767  putative flagellar protein FliT  32.18 
 
 
108 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.684453 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3106  hypothetical protein  31.82 
 
 
110 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3080  hypothetical protein  31.82 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3061  hypothetical protein  31.82 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.151059  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6410  hypothetical protein  29.07 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.172158 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2447  hypothetical protein  31.82 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120325  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2949  hypothetical protein  31.33 
 
 
108 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3397  hypothetical protein  31.33 
 
 
108 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0237  hypothetical protein  31.33 
 
 
108 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0225  hypothetical protein  31.33 
 
 
108 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11841  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2139  hypothetical protein  31.33 
 
 
108 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3284  hypothetical protein  31.33 
 
 
108 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5256  putative flagellar protein FliT  25 
 
 
114 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0330194 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>