35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3106 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_3106  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  213  8e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2972  hypothetical protein  98.18 
 
 		 110 aa  206  9e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.10272  normal  0.124393 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3080  hypothetical protein  91.82 
 
 		 110 aa  194  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3061  hypothetical protein  91.82 
 
 		 110 aa  194  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.151059  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2447  hypothetical protein  91.82 
 
 		 110 aa  194  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120325  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6410  hypothetical protein  90 
 
 		 110 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172158 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3058  hypothetical protein  82.73 
 
 		 110 aa  174  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3397  hypothetical protein  73.64 
 
 		 108 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0237  hypothetical protein  73.64 
 
 		 108 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0225  hypothetical protein  73.64 
 
 		 108 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11841  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2139  hypothetical protein  73.64 
 
 		 108 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2949  hypothetical protein  73.64 
 
 		 108 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3284  hypothetical protein  73.64 
 
 		 108 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0203  hypothetical protein  72.73 
 
 		 108 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3767  putative flagellar protein FliT  62.39 
 
 		 108 aa  120  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.684453 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0169  putative flagellar protein FliT  61.47 
 
 		 108 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.370668 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2928  putative flagellar protein FliT  54.13 
 
 		 109 aa  110  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5093  flagellar protein FliT  42.53 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4747  putative flagellar protein FliT  32.32 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.408466 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3670  flagellar protein FliT  32.32 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643949  normal  0.821667 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1594  flagellar protein FliT  35.87 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0385  flagellar protein FliT  35.11 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.691799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5256  putative flagellar protein FliT  35.71 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0330194 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1341  flagellar protein FliT  32.41 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0498438  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2897  hypothetical protein  38.96 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2863  flagellar chaperone  34.88 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3139  hypothetical protein  38.3 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.529843  normal  0.437682 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2773  flagellar export chaperone  38.3 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.804206 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1982  flagellar protein FliT  29.9 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1013  flagellar chaperone  34.88 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0621  flagellar protein FliT  31.82 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4397  flagellar protein FliT  33.33 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3809  flagellar protein FliT  30.23 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3083  flagellar protein FliT  30.23 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.88004  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4163  hypothetical protein  42.25 
 
 		 92 aa  41.6  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>