18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0634 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_0634  flagellar protein FliT  100 
 
 
99 aa  206  8e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3809  flagellar protein FliT  68.69 
 
 
99 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3083  flagellar protein FliT  68.69 
 
 
99 aa  137  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.88004  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0621  flagellar protein FliT  64.65 
 
 
99 aa  131  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4397  flagellar protein FliT  65.62 
 
 
99 aa  127  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1111  flagellar protein FliT  65.26 
 
 
98 aa  122  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2863  flagellar chaperone  53.54 
 
 
99 aa  105  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1013  flagellar chaperone  54.17 
 
 
114 aa  98.6  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5093  flagellar protein FliT  36.17 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2897  hypothetical protein  35.79 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1341  flagellar protein FliT  31.58 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0498438  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1594  flagellar protein FliT  31.87 
 
 
109 aa  45.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2773  flagellar export chaperone  34.69 
 
 
125 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.804206 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3139  hypothetical protein  34.69 
 
 
125 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.529843  normal  0.437682 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1982  flagellar protein FliT  32.47 
 
 
113 aa  44.3  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3670  flagellar protein FliT  28.41 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643949  normal  0.821667 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4747  putative flagellar protein FliT  28.41 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.408466 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0385  flagellar protein FliT  29.55 
 
 
118 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.691799  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>