20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1111 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1111  flagellar protein FliT  100 
 
 
98 aa  196  7e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3809  flagellar protein FliT  65.98 
 
 
99 aa  134  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3083  flagellar protein FliT  67.37 
 
 
99 aa  133  8e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.88004  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4397  flagellar protein FliT  70.21 
 
 
99 aa  128  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0621  flagellar protein FliT  60 
 
 
99 aa  122  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0634  flagellar protein FliT  65.26 
 
 
99 aa  122  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2863  flagellar chaperone  52.58 
 
 
99 aa  99.8  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1013  flagellar chaperone  55.56 
 
 
114 aa  96.3  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1594  flagellar protein FliT  33.71 
 
 
109 aa  55.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1982  flagellar protein FliT  30.43 
 
 
113 aa  49.7  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1341  flagellar protein FliT  32.14 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0498438  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2773  flagellar export chaperone  41.98 
 
 
125 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.804206 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3139  hypothetical protein  41.98 
 
 
125 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.529843  normal  0.437682 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5093  flagellar protein FliT  36.26 
 
 
110 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2897  hypothetical protein  37.5 
 
 
122 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3670  flagellar protein FliT  32.1 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643949  normal  0.821667 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4747  putative flagellar protein FliT  32.1 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.408466 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0203  hypothetical protein  35.56 
 
 
108 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2928  putative flagellar protein FliT  31 
 
 
109 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0385  flagellar protein FliT  32.1 
 
 
118 aa  40  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.691799  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>