32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_24270 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_24270  flagellar protein  100 
 
 		 127 aa  247  4e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5093  flagellar protein FliT  35.85 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2031  hypothetical protein  39.62 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.29372  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5256  putative flagellar protein FliT  33.02 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0330194 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2124  flagellar biosynthesis protein FliT  33.96 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110928  hitchhiker  0.00000066178 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2177  flagellar biosynthesis protein FliT  33.96 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.925839  normal  0.0161176 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2119  flagellar biosynthesis protein FliT  33.96 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136098  normal  0.180816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1158  flagellar biosynthesis protein FliT  33.96 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0236782  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1281  flagellar biosynthesis protein FliT  33.96 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000909072  normal  0.322252 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2573  flagellar biosynthesis protein FliT  29.91 
 
 		 126 aa  50.4  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.694894  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3139  hypothetical protein  34.95 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.529843  normal  0.437682 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2773  flagellar export chaperone  34.95 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.804206 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2897  hypothetical protein  35.64 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0169  putative flagellar protein FliT  43.21 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.370668 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3767  putative flagellar protein FliT  43.21 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.684453 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2863  flagellar chaperone  38.67 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1893  flagellar biosynthesis protein FliT  32.08 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1578  flagellar export chaperone  27 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3284  hypothetical protein  43.66 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3397  hypothetical protein  43.66 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0237  hypothetical protein  43.66 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0225  hypothetical protein  43.66 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11841  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2139  hypothetical protein  43.66 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2949  hypothetical protein  43.66 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1013  flagellar chaperone  36.36 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0203  hypothetical protein  43.66 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1538  flagellar export chaperone  35.64 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.472804  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6410  hypothetical protein  37.04 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172158 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3080  hypothetical protein  40.85 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3061  hypothetical protein  40.85 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.151059  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2447  hypothetical protein  40.85 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120325  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2972  hypothetical protein  35.35 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.10272  normal  0.124393 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>