23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2124 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A1281  flagellar biosynthesis protein FliT  100 
 
 
122 aa  242  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000909072  normal  0.322252 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1158  flagellar biosynthesis protein FliT  100 
 
 
122 aa  242  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0236782  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2124  flagellar biosynthesis protein FliT  100 
 
 
122 aa  242  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110928  hitchhiker  0.00000066178 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2177  flagellar biosynthesis protein FliT  100 
 
 
122 aa  242  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.925839  normal  0.0161176 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2119  flagellar biosynthesis protein FliT  100 
 
 
122 aa  242  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136098  normal  0.180816 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2525  flagellar biosynthesis protein FliT  43.12 
 
 
120 aa  97.1  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2573  flagellar biosynthesis protein FliT  38.79 
 
 
126 aa  90.5  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.694894  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2943  flagellar biosynthesis protein FliT  37.74 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.36645  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2026  flagellar biosynthesis protein FliT  33.62 
 
 
121 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2701  flagellar biosynthesis protein FliT  35.85 
 
 
121 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1713  flagellar biosynthesis protein FliT  35.85 
 
 
121 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.166175 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1720  flagellar export chaperone  35.85 
 
 
121 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.918748  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1255  flagellar biosynthesis protein FliT  33.62 
 
 
121 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.953619  normal  0.256346 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1893  flagellar biosynthesis protein FliT  33.64 
 
 
111 aa  71.2  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1578  flagellar export chaperone  35.09 
 
 
120 aa  71.2  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2161  flagellar biosynthesis protein FliT  35.85 
 
 
121 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2384  flagellar biosynthesis protein FliT  35.58 
 
 
120 aa  70.5  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2285  flagellar biosynthesis protein FliT  35.58 
 
 
120 aa  70.5  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1538  flagellar export chaperone  37.61 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.472804  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2020  flagellar biosynthesis protein FliT  36.05 
 
 
98 aa  61.6  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2031  hypothetical protein  31.25 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.29372  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5256  putative flagellar protein FliT  27.1 
 
 
114 aa  55.1  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0330194 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24270  flagellar protein  33.96 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>