24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2573 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2573  flagellar biosynthesis protein FliT  100 
 
 		 126 aa  256  7e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.694894  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1893  flagellar biosynthesis protein FliT  60.91 
 
 		 111 aa  141  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1578  flagellar export chaperone  47.83 
 
 		 120 aa  107  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2285  flagellar biosynthesis protein FliT  41.18 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2384  flagellar biosynthesis protein FliT  41.18 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1281  flagellar biosynthesis protein FliT  38.79 
 
 		 122 aa  90.5  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000909072  normal  0.322252 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1158  flagellar biosynthesis protein FliT  38.79 
 
 		 122 aa  90.5  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0236782  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2119  flagellar biosynthesis protein FliT  38.79 
 
 		 122 aa  90.5  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136098  normal  0.180816 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2177  flagellar biosynthesis protein FliT  38.79 
 
 		 122 aa  90.5  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.925839  normal  0.0161176 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2124  flagellar biosynthesis protein FliT  38.79 
 
 		 122 aa  90.5  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110928  hitchhiker  0.00000066178 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2525  flagellar biosynthesis protein FliT  42.34 
 
 		 120 aa  89  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1255  flagellar biosynthesis protein FliT  44.17 
 
 		 121 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.953619  normal  0.256346 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2161  flagellar biosynthesis protein FliT  44.17 
 
 		 121 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1713  flagellar biosynthesis protein FliT  44.07 
 
 		 121 aa  87.4  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.166175 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1720  flagellar export chaperone  43.33 
 
 		 121 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.918748  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2701  flagellar biosynthesis protein FliT  43.33 
 
 		 121 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2026  flagellar biosynthesis protein FliT  42.37 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2020  flagellar biosynthesis protein FliT  39.58 
 
 		 98 aa  80.1  0.000000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1538  flagellar export chaperone  36.13 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.472804  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2943  flagellar biosynthesis protein FliT  40 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.36645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2031  hypothetical protein  32.11 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.29372  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24270  flagellar protein  29.91 
 
 		 127 aa  50.4  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5256  putative flagellar protein FliT  26.85 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0330194 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5093  flagellar protein FliT  22.73 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>