23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2031 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2031  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  253  9e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.29372  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2573  flagellar biosynthesis protein FliT  32.11 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.694894  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24270  flagellar protein  39.62 
 
 
127 aa  62.8  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5256  putative flagellar protein FliT  33.64 
 
 
114 aa  60.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0330194 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1538  flagellar export chaperone  37.07 
 
 
124 aa  60.5  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.472804  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1281  flagellar biosynthesis protein FliT  31.25 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000909072  normal  0.322252 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1158  flagellar biosynthesis protein FliT  31.25 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0236782  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2119  flagellar biosynthesis protein FliT  31.25 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136098  normal  0.180816 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2177  flagellar biosynthesis protein FliT  31.25 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.925839  normal  0.0161176 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2124  flagellar biosynthesis protein FliT  31.25 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110928  hitchhiker  0.00000066178 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1893  flagellar biosynthesis protein FliT  34.38 
 
 
111 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5093  flagellar protein FliT  30.84 
 
 
110 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2384  flagellar biosynthesis protein FliT  32.65 
 
 
120 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2026  flagellar biosynthesis protein FliT  25.45 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2285  flagellar biosynthesis protein FliT  32.65 
 
 
120 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1255  flagellar biosynthesis protein FliT  27.66 
 
 
121 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.953619  normal  0.256346 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1713  flagellar biosynthesis protein FliT  27.66 
 
 
121 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.166175 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2161  flagellar biosynthesis protein FliT  27.66 
 
 
121 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2701  flagellar biosynthesis protein FliT  27.66 
 
 
121 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2525  flagellar biosynthesis protein FliT  24.78 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1720  flagellar export chaperone  27.66 
 
 
121 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.918748  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1578  flagellar export chaperone  24.53 
 
 
120 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1341  flagellar protein FliT  33.71 
 
 
113 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0498438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>