21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2026 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A2026  flagellar biosynthesis protein FliT  100 
 
 
121 aa  246  5e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1720  flagellar export chaperone  98.35 
 
 
121 aa  242  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.918748  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2161  flagellar biosynthesis protein FliT  97.52 
 
 
121 aa  241  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2701  flagellar biosynthesis protein FliT  98.35 
 
 
121 aa  242  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1255  flagellar biosynthesis protein FliT  97.5 
 
 
121 aa  239  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.953619  normal  0.256346 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1713  flagellar biosynthesis protein FliT  96.67 
 
 
121 aa  238  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.166175 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2285  flagellar biosynthesis protein FliT  46.73 
 
 
120 aa  90.9  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2384  flagellar biosynthesis protein FliT  46.73 
 
 
120 aa  90.9  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2573  flagellar biosynthesis protein FliT  42.37 
 
 
126 aa  85.9  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.694894  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2943  flagellar biosynthesis protein FliT  49.43 
 
 
122 aa  84.3  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.36645  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2020  flagellar biosynthesis protein FliT  47.62 
 
 
98 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2525  flagellar biosynthesis protein FliT  42.24 
 
 
120 aa  74.7  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1893  flagellar biosynthesis protein FliT  39.64 
 
 
111 aa  72.8  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2119  flagellar biosynthesis protein FliT  33.62 
 
 
122 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136098  normal  0.180816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1158  flagellar biosynthesis protein FliT  33.62 
 
 
122 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0236782  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1281  flagellar biosynthesis protein FliT  33.62 
 
 
122 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000909072  normal  0.322252 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2177  flagellar biosynthesis protein FliT  33.62 
 
 
122 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.925839  normal  0.0161176 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2124  flagellar biosynthesis protein FliT  33.62 
 
 
122 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110928  hitchhiker  0.00000066178 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1538  flagellar export chaperone  41 
 
 
124 aa  70.5  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.472804  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1578  flagellar export chaperone  34.78 
 
 
120 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2031  hypothetical protein  25.45 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.29372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>