22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2161 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_2161  flagellar biosynthesis protein FliT  100 
 
 
121 aa  247  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1720  flagellar export chaperone  99.17 
 
 
121 aa  247  5e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.918748  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2701  flagellar biosynthesis protein FliT  99.17 
 
 
121 aa  247  5e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1255  flagellar biosynthesis protein FliT  100 
 
 
121 aa  244  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.953619  normal  0.256346 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1713  flagellar biosynthesis protein FliT  99.17 
 
 
121 aa  243  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.166175 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2026  flagellar biosynthesis protein FliT  97.52 
 
 
121 aa  241  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2285  flagellar biosynthesis protein FliT  46.73 
 
 
120 aa  89.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2384  flagellar biosynthesis protein FliT  46.73 
 
 
120 aa  89.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2573  flagellar biosynthesis protein FliT  44.17 
 
 
126 aa  88.2  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.694894  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2943  flagellar biosynthesis protein FliT  49.43 
 
 
122 aa  83.6  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.36645  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2020  flagellar biosynthesis protein FliT  47.62 
 
 
98 aa  75.5  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1893  flagellar biosynthesis protein FliT  38.89 
 
 
111 aa  74.3  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2525  flagellar biosynthesis protein FliT  44.34 
 
 
120 aa  73.2  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1538  flagellar export chaperone  41 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.472804  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2124  flagellar biosynthesis protein FliT  35.85 
 
 
122 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110928  hitchhiker  0.00000066178 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2177  flagellar biosynthesis protein FliT  35.85 
 
 
122 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.925839  normal  0.0161176 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2119  flagellar biosynthesis protein FliT  35.85 
 
 
122 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136098  normal  0.180816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1158  flagellar biosynthesis protein FliT  35.85 
 
 
122 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0236782  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1281  flagellar biosynthesis protein FliT  35.85 
 
 
122 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000909072  normal  0.322252 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1578  flagellar export chaperone  33.91 
 
 
120 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2031  hypothetical protein  27.66 
 
 
127 aa  45.1  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.29372  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0705  flagellar protein FliT  36.49 
 
 
111 aa  40.8  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0314292  normal  0.259301 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>