34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1538 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1538  flagellar export chaperone  100 
 
 		 124 aa  252  1.0000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.472804  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2384  flagellar biosynthesis protein FliT  44.35 
 
 		 120 aa  84.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2285  flagellar biosynthesis protein FliT  44.35 
 
 		 120 aa  84.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2573  flagellar biosynthesis protein FliT  36.13 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.694894  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2943  flagellar biosynthesis protein FliT  42.57 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.36645  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1720  flagellar export chaperone  41 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.918748  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2701  flagellar biosynthesis protein FliT  41 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1713  flagellar biosynthesis protein FliT  41 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.166175 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2161  flagellar biosynthesis protein FliT  41 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1255  flagellar biosynthesis protein FliT  41 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.953619  normal  0.256346 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2525  flagellar biosynthesis protein FliT  36.21 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2026  flagellar biosynthesis protein FliT  41 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1281  flagellar biosynthesis protein FliT  37.61 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000909072  normal  0.322252 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1158  flagellar biosynthesis protein FliT  37.61 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0236782  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2124  flagellar biosynthesis protein FliT  37.61 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110928  hitchhiker  0.00000066178 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2177  flagellar biosynthesis protein FliT  37.61 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.925839  normal  0.0161176 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2119  flagellar biosynthesis protein FliT  37.61 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136098  normal  0.180816 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2020  flagellar biosynthesis protein FliT  45.45 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2031  hypothetical protein  37.07 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.29372  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5093  flagellar protein FliT  33.98 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1893  flagellar biosynthesis protein FliT  38.1 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1578  flagellar export chaperone  33.33 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5256  putative flagellar protein FliT  30 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0330194 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0385  flagellar protein FliT  28.85 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.691799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1341  flagellar protein FliT  30.39 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0498438  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2928  putative flagellar protein FliT  32.22 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3139  hypothetical protein  26.67 
 
 		 125 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.529843  normal  0.437682 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3767  putative flagellar protein FliT  33.33 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.684453 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2773  flagellar export chaperone  26.67 
 
 		 125 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.804206 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1594  flagellar protein FliT  33.33 
 
 		 109 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24270  flagellar protein  35.64 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0169  putative flagellar protein FliT  32.61 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.370668 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4747  putative flagellar protein FliT  26.17 
 
 		 118 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.408466 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3670  flagellar protein FliT  26.17 
 
 		 118 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643949  normal  0.821667 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>