21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2349 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2349  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  169  9e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240227  normal  0.168126 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0409  hypothetical protein  52.7 
 
 		 83 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.74354  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0161  protein of unknown function UPF0175  47.37 
 
 		 86 aa  75.1  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0647  hypothetical protein  47.37 
 
 		 86 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1353  protein of unknown function UPF0175  43.9 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00774094  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1082  hypothetical protein  40.79 
 
 		 88 aa  67  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.109568  normal  0.721009 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5307  hypothetical protein  36.59 
 
 		 83 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.276905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1083  hypothetical protein  34.15 
 
 		 84 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5352  protein of unknown function UPF0175  34.15 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.104771 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0312  hypothetical protein  36.84 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4641  hypothetical protein  43.1 
 
 		 72 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0052  protein of unknown function UPF0175  40.28 
 
 		 82 aa  53.5  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0476842  normal  0.242874 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2482  hypothetical protein  36.99 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2613  protein of unknown function UPF0175  39.02 
 
 		 75 aa  53.5  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0173  hypothetical protein  35 
 
 		 83 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.315978 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4046  protein of unknown function UPF0175  31.17 
 
 		 98 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1485  hypothetical protein  41.25 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.152276  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4274  hypothetical protein  31.17 
 
 		 83 aa  45.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3500  hypothetical protein  32.05 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.126355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1012  protein of unknown function UPF0175  29.27 
 
 		 75 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2825  hypothetical protein  30.77 
 
 		 92 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00979605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>