12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2482 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2482  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  165  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1082  hypothetical protein  33.33 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.109568  normal  0.721009 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2349  hypothetical protein  39.39 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240227  normal  0.168126 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5307  hypothetical protein  35 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.276905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1353  protein of unknown function UPF0175  37.66 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00774094  n/a   
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4641  hypothetical protein  43.4 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0409  hypothetical protein  36.62 
 
 		 83 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.74354  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5352  protein of unknown function UPF0175  28.95 
 
 		 84 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.104771 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4046  protein of unknown function UPF0175  25.64 
 
 		 98 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1012  protein of unknown function UPF0175  32.08 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0173  hypothetical protein  32.5 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.315978 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2613  protein of unknown function UPF0175  31.94 
 
 		 75 aa  40.8  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188642  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>