22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5352 on replicon NC_011880
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011880  Cyan7425_5352  protein of unknown function UPF0175  100 
 
 
84 aa  168  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.104771 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1083  hypothetical protein  65.48 
 
 
84 aa  124  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4274  hypothetical protein  53.75 
 
 
83 aa  91.3  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1353  protein of unknown function UPF0175  42.5 
 
 
94 aa  65.1  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00774094  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0409  hypothetical protein  42.11 
 
 
83 aa  63.5  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.74354  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0161  protein of unknown function UPF0175  38.75 
 
 
86 aa  62.8  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1082  hypothetical protein  37.97 
 
 
88 aa  62  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.109568  normal  0.721009 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0647  hypothetical protein  37.5 
 
 
86 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4641  hypothetical protein  35 
 
 
72 aa  53.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2349  hypothetical protein  36.36 
 
 
86 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240227  normal  0.168126 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0173  hypothetical protein  31.33 
 
 
83 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.315978 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5307  hypothetical protein  30.12 
 
 
83 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.276905  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0052  protein of unknown function UPF0175  36.14 
 
 
82 aa  50.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0476842  normal  0.242874 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4046  protein of unknown function UPF0175  29.76 
 
 
98 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2613  protein of unknown function UPF0175  32.53 
 
 
75 aa  48.9  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188642  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0101  protein of unknown function UPF0175  30.99 
 
 
87 aa  47  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1012  protein of unknown function UPF0175  31.33 
 
 
75 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3145  protein of unknown function UPF0175  33.75 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0312  hypothetical protein  29.49 
 
 
86 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2482  hypothetical protein  28.95 
 
 
82 aa  45.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2825  hypothetical protein  25.32 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00979605  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1722  hypothetical protein  33.77 
 
 
83 aa  41.6  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>