20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1083 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1083  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  170  5.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5352  protein of unknown function UPF0175  65.48 
 
 		 84 aa  124  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.104771 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4274  hypothetical protein  47.5 
 
 		 83 aa  82.4  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5307  hypothetical protein  40.96 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.276905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0173  hypothetical protein  40.96 
 
 		 83 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.315978 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0409  hypothetical protein  39.39 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.74354  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1082  hypothetical protein  32.91 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.109568  normal  0.721009 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0052  protein of unknown function UPF0175  36.14 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0476842  normal  0.242874 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4046  protein of unknown function UPF0175  32.93 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2349  hypothetical protein  36.92 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240227  normal  0.168126 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0161  protein of unknown function UPF0175  33.33 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0647  hypothetical protein  33.33 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1353  protein of unknown function UPF0175  36.25 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00774094  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0101  protein of unknown function UPF0175  33.8 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1012  protein of unknown function UPF0175  28.92 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4641  hypothetical protein  30 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3145  protein of unknown function UPF0175  30 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2825  hypothetical protein  25.64 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00979605  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0312  hypothetical protein  26.92 
 
 		 86 aa  45.1  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1722  hypothetical protein  32.47 
 
 		 83 aa  40  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>