17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4641 on replicon NC_013168
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013168  Cyan8802_4641  hypothetical protein  100 
 
 
72 aa  144  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0052  protein of unknown function UPF0175  45.83 
 
 
82 aa  70.5  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0476842  normal  0.242874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1012  protein of unknown function UPF0175  38.89 
 
 
75 aa  61.6  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1246  hypothetical protein  41.67 
 
 
86 aa  57.4  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2613  protein of unknown function UPF0175  37.5 
 
 
75 aa  57  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188642  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3145  protein of unknown function UPF0175  35.62 
 
 
77 aa  56.6  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5352  protein of unknown function UPF0175  35 
 
 
84 aa  53.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.104771 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4046  protein of unknown function UPF0175  46.43 
 
 
98 aa  53.9  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2349  hypothetical protein  52.17 
 
 
86 aa  50.4  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240227  normal  0.168126 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2825  hypothetical protein  35.09 
 
 
92 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00979605  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2482  hypothetical protein  43.4 
 
 
82 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1083  hypothetical protein  30 
 
 
84 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1082  hypothetical protein  37.5 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.109568  normal  0.721009 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1353  protein of unknown function UPF0175  40 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00774094  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0161  protein of unknown function UPF0175  40 
 
 
86 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0647  hypothetical protein  40 
 
 
86 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0101  protein of unknown function UPF0175  29.17 
 
 
87 aa  40.8  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>