20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0161 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0161  protein of unknown function UPF0175  100 
 
 		 86 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0647  hypothetical protein  95.35 
 
 		 86 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0409  hypothetical protein  77.11 
 
 		 83 aa  135  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.74354  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2349  hypothetical protein  45.59 
 
 		 86 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240227  normal  0.168126 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1082  hypothetical protein  44.44 
 
 		 88 aa  63.5  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.109568  normal  0.721009 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5352  protein of unknown function UPF0175  38.75 
 
 		 84 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.104771 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5307  hypothetical protein  45.57 
 
 		 83 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.276905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0173  hypothetical protein  40.74 
 
 		 83 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.315978 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1083  hypothetical protein  33.33 
 
 		 84 aa  54.7  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4274  hypothetical protein  31.17 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1353  protein of unknown function UPF0175  42.19 
 
 		 94 aa  51.6  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00774094  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1012  protein of unknown function UPF0175  35.37 
 
 		 75 aa  47.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0052  protein of unknown function UPF0175  32.89 
 
 		 82 aa  45.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0476842  normal  0.242874 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0312  hypothetical protein  30.12 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4046  protein of unknown function UPF0175  34.38 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1355  hypothetical protein  39.73 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000717055  normal  0.0110811 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2825  hypothetical protein  29.23 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00979605  n/a   
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4641  hypothetical protein  40 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2613  protein of unknown function UPF0175  26.83 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0516  hypothetical protein  30.77 
 
 		 88 aa  40  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>