19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2825 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2825  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  184  4e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00979605  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4046  protein of unknown function UPF0175  34.57 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4274  hypothetical protein  33.33 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1722  hypothetical protein  35.82 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4641  hypothetical protein  35.09 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0052  protein of unknown function UPF0175  35 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0476842  normal  0.242874 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0409  hypothetical protein  32.35 
 
 		 83 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.74354  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5307  hypothetical protein  37.68 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.276905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1083  hypothetical protein  25.64 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1451  protein of unknown function UPF0175  37.14 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1355  hypothetical protein  34.21 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000717055  normal  0.0110811 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1353  protein of unknown function UPF0175  30.23 
 
 		 94 aa  43.9  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00774094  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5352  protein of unknown function UPF0175  25.32 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.104771 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3294  protein of unknown function UPF0175  39.13 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.214497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1012  protein of unknown function UPF0175  32.91 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0161  protein of unknown function UPF0175  29.23 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1611  hypothetical protein  28.4 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2800  protein of unknown function UPF0175  38.1 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0101  protein of unknown function UPF0175  32.39 
 
 		 87 aa  40  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>