20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1353 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1353  protein of unknown function UPF0175  100 
 
 
94 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00774094  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5352  protein of unknown function UPF0175  42.5 
 
 
84 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.104771 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2349  hypothetical protein  49.28 
 
 
86 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240227  normal  0.168126 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1082  hypothetical protein  37.04 
 
 
88 aa  62.4  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.109568  normal  0.721009 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0409  hypothetical protein  45.31 
 
 
83 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.74354  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1083  hypothetical protein  36.25 
 
 
84 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0161  protein of unknown function UPF0175  42.19 
 
 
86 aa  51.6  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0647  hypothetical protein  42.19 
 
 
86 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2482  hypothetical protein  37.66 
 
 
82 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5307  hypothetical protein  32.53 
 
 
83 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.276905  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4274  hypothetical protein  35.8 
 
 
83 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0173  hypothetical protein  33.73 
 
 
83 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.315978 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4046  protein of unknown function UPF0175  30.85 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0052  protein of unknown function UPF0175  34.25 
 
 
82 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0476842  normal  0.242874 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3145  protein of unknown function UPF0175  33.33 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2825  hypothetical protein  30.23 
 
 
92 aa  43.9  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00979605  n/a   
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4641  hypothetical protein  40 
 
 
72 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1451  protein of unknown function UPF0175  37.5 
 
 
84 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0312  hypothetical protein  33.33 
 
 
86 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2613  protein of unknown function UPF0175  31.33 
 
 
75 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188642  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>