17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2613 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2613  protein of unknown function UPF0175  100 
 
 		 75 aa  148  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0052  protein of unknown function UPF0175  49.33 
 
 		 82 aa  83.6  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0476842  normal  0.242874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1012  protein of unknown function UPF0175  46.67 
 
 		 75 aa  82.4  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1246  hypothetical protein  46.67 
 
 		 86 aa  77.4  0.00000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3145  protein of unknown function UPF0175  37.5 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4641  hypothetical protein  37.5 
 
 		 72 aa  57  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5849  hypothetical protein  30 
 
 		 73 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5352  protein of unknown function UPF0175  32.53 
 
 		 84 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.104771 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2349  hypothetical protein  42.42 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240227  normal  0.168126 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0409  hypothetical protein  34.62 
 
 		 83 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.74354  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5307  hypothetical protein  37.93 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.276905  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2002  hypothetical protein  32.81 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.873987  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4274  hypothetical protein  31.25 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1353  protein of unknown function UPF0175  31.33 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00774094  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2482  hypothetical protein  31.94 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0161  protein of unknown function UPF0175  26.83 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0647  hypothetical protein  26.83 
 
 		 86 aa  40  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>