22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1012 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1012  protein of unknown function UPF0175  100 
 
 		 75 aa  151  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0052  protein of unknown function UPF0175  66.67 
 
 		 82 aa  110  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0476842  normal  0.242874 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1246  hypothetical protein  50.67 
 
 		 86 aa  90.9  6e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3145  protein of unknown function UPF0175  62.5 
 
 		 77 aa  88.6  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2613  protein of unknown function UPF0175  46.67 
 
 		 75 aa  82.4  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4641  hypothetical protein  38.89 
 
 		 72 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5307  hypothetical protein  39.76 
 
 		 83 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.276905  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2002  hypothetical protein  38.6 
 
 		 66 aa  49.7  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.873987  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5849  hypothetical protein  39.66 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1083  hypothetical protein  28.92 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0161  protein of unknown function UPF0175  35.37 
 
 		 86 aa  47.4  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5352  protein of unknown function UPF0175  31.33 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.104771 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0409  hypothetical protein  34.62 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.74354  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0647  hypothetical protein  34.15 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4046  protein of unknown function UPF0175  31.71 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0173  hypothetical protein  37.68 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.315978 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0101  protein of unknown function UPF0175  41.67 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2825  hypothetical protein  32.91 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00979605  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1451  protein of unknown function UPF0175  33.33 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4031  hypothetical protein  34.62 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.297352 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2482  hypothetical protein  32.08 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4274  hypothetical protein  27.5 
 
 		 83 aa  40.4  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.237856 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>