15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4031 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4031  hypothetical protein  100 
 
 
82 aa  162  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.297352 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2063  protein of unknown function UPF0175  80.49 
 
 
82 aa  133  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1355  hypothetical protein  53.66 
 
 
81 aa  85.9  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000717055  normal  0.0110811 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3487  protein of unknown function UPF0175  51.22 
 
 
81 aa  80.5  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1451  protein of unknown function UPF0175  46.15 
 
 
84 aa  70.1  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3500  hypothetical protein  40.24 
 
 
81 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.126355 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3294  protein of unknown function UPF0175  35.53 
 
 
75 aa  50.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.214497  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0173  hypothetical protein  35.44 
 
 
83 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.315978 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1246  hypothetical protein  38.33 
 
 
86 aa  44.3  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1485  hypothetical protein  33.77 
 
 
85 aa  43.9  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.152276  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5307  hypothetical protein  35.44 
 
 
83 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.276905  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1770  protein of unknown function UPF0175  32.93 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00752388  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4274  hypothetical protein  29.49 
 
 
83 aa  41.6  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1012  protein of unknown function UPF0175  34.62 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0158  protein of unknown function UPF0175  38.18 
 
 
82 aa  40  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>