19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1485 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1485  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  169  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.152276  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1189  hypothetical protein  50.59 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.146128 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2857  protein of unknown function UPF0175  44.44 
 
 		 84 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0158  protein of unknown function UPF0175  46.25 
 
 		 82 aa  74.7  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1355  hypothetical protein  36.84 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000717055  normal  0.0110811 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1451  protein of unknown function UPF0175  38.57 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3500  hypothetical protein  36.84 
 
 		 81 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.126355 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1082  hypothetical protein  37.31 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.109568  normal  0.721009 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3487  protein of unknown function UPF0175  32.89 
 
 		 81 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4274  hypothetical protein  31.25 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2063  protein of unknown function UPF0175  33.77 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0409  hypothetical protein  38.6 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.74354  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4031  hypothetical protein  33.77 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.297352 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0101  protein of unknown function UPF0175  38.6 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0312  hypothetical protein  37.5 
 
 		 86 aa  42.7  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4046  protein of unknown function UPF0175  28.75 
 
 		 98 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2349  hypothetical protein  42.37 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240227  normal  0.168126 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5307  hypothetical protein  36.84 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.276905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0173  hypothetical protein  38.6 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.315978 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>