18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0647 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0647  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  171  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0161  protein of unknown function UPF0175  95.35 
 
 		 86 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0409  hypothetical protein  78.31 
 
 		 83 aa  135  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.74354  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2349  hypothetical protein  47.06 
 
 		 86 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240227  normal  0.168126 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1082  hypothetical protein  48.48 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.109568  normal  0.721009 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5352  protein of unknown function UPF0175  37.5 
 
 		 84 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.104771 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5307  hypothetical protein  45.33 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.276905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0173  hypothetical protein  40.74 
 
 		 83 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.315978 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4274  hypothetical protein  32.47 
 
 		 83 aa  53.5  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1083  hypothetical protein  33.33 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1353  protein of unknown function UPF0175  42.19 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00774094  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1012  protein of unknown function UPF0175  34.15 
 
 		 75 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0052  protein of unknown function UPF0175  34.21 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0476842  normal  0.242874 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4046  protein of unknown function UPF0175  34.18 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0312  hypothetical protein  34.85 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4641  hypothetical protein  40 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0516  hypothetical protein  32.05 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2613  protein of unknown function UPF0175  26.83 
 
 		 75 aa  40  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188642  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>