86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4272 on replicon NC_009008
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009008  RSP_4272  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  100 
 
 		 287 aa  550  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0321448  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4122  periplasmic binding protein  98.61 
 
 		 287 aa  542  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2777  periplasmic binding protein  41.84 
 
 		 290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1305  periplasmic binding protein  35.81 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2782  periplasmic binding protein  34.44 
 
 		 301 aa  103  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179972 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50340  iron(III)-siderophore-binding periplasmic protein  34.23 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.318256  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1050  periplasmic binding protein  31.94 
 
 		 308 aa  96.7  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.637791  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0151  ferrichrome-binding periplasmic protein  26.59 
 
 		 296 aa  92.8  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1140  periplasmic binding protein  32.48 
 
 		 292 aa  91.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.403582 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0692  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  28.62 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.40073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0088  periplasmic binding protein  33.46 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2813  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  27.49 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137068  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1439  ABC Fe+3 hydroxamate (ferrichrome) transporter, periplasmic siderophore binding protein  33.46 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0617961  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06298  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component  26.62 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2189  periplasmic binding protein  27.37 
 
 		 309 aa  75.5  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2582  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  27.76 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00742029  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3767  periplasmic binding protein  30.82 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0570173 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3580  ABC transporter substrate binding protein (ferrichrome)  29.96 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6475  periplasmic binding protein  28.17 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.99145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6720  periplasmic binding protein  30.07 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0397783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0144  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  26.62 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00151  iron-hydroxamate transporter subunit  26.62 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000912024  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0164  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  26.62 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0157  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  26.62 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00150  hypothetical protein  26.62 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000817605  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3450  periplasmic binding protein  26.62 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0202781  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0162  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  26.62 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0156  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  26.62 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3507  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  26.62 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000933155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0229  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  25.29 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001282  ferrichrome-binding periplasmic protein precursor  26.87 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0287347  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0222  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  24.9 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1009  periplasmic binding protein  25.36 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0211  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  24.9 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.687941  normal  0.911967 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0226  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  24.9 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0210  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  24.9 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3977  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  25.34 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2754  periplasmic binding protein  27.13 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003569  ferrichrome-binding periplasmic protein precursor  22.87 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4802  periplasmic binding protein  28.51 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2829  twin-arginine translocation pathway signal  25.89 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.582079  normal  0.501847 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3108  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  23.85 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1739  periplasmic binding protein  26.18 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3055  periplasmic binding protein  27.53 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2421  periplasmic binding protein  27.3 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1170  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  25.77 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0997  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  25.4 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3461  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  24.81 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3332  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  25.4 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0754  FecB protein  21.69 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.036257  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0297  periplasmic binding protein  25.29 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4356  periplasmic binding protein  21.32 
 
 		 324 aa  53.5  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200584  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2464  periplasmic binding protein  26.74 
 
 		 351 aa  52.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3867  periplasmic binding protein  22.98 
 
 		 316 aa  52.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3006  periplasmic binding protein  26.07 
 
 		 323 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000872472 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4641  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  21.56 
 
 		 324 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0599  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  21.56 
 
 		 324 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.717603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4636  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  21.56 
 
 		 324 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.471711  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4766  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  21.56 
 
 		 324 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00286539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4264  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  21.56 
 
 		 324 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4424  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  21.56 
 
 		 324 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000518711  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2208  periplasmic binding protein  24.81 
 
 		 327 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.970371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2246  periplasmic binding protein  24.81 
 
 		 327 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.13483  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4784  ABC Fe3+-siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  25.27 
 
 		 345 aa  49.7  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.119601  normal  0.931379 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1738  periplasmic binding protein  24.5 
 
 		 363 aa  49.3  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.028401  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4069  periplasmic binding protein  27.9 
 
 		 342 aa  48.9  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.423894 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1909  periplasmic binding protein  25.4 
 
 		 335 aa  48.1  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1158  periplasmic binding protein  26.71 
 
 		 341 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360135  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1638  periplasmic binding protein  26.71 
 
 		 341 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.120815  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1556  periplasmic binding protein  27.5 
 
 		 345 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243327  normal  0.668658 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1535  periplasmic binding protein  26.71 
 
 		 345 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118681  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1613  periplasmic binding protein  25.86 
 
 		 341 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109769  normal  0.0743729 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30480  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.14 
 
 		 332 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.178307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1600  periplasmic binding protein  25.62 
 
 		 344 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243459 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1923  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  25.98 
 
 		 398 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1683  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0523  ABC Fe3+-hydroxamate transporter, periplasmic ligand binding protein  26.1 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2491  periplasmic binding protein  26.29 
 
 		 316 aa  43.5  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.655345 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1185  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  25.75 
 
 		 342 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145194  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0870  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  25.75 
 
 		 398 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322201  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4041  periplasmic binding protein  25.63 
 
 		 341 aa  43.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1394  periplasmic binding protein  26.57 
 
 		 332 aa  43.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0164241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0291  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  25.75 
 
 		 398 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0133819  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1628  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  25.75 
 
 		 398 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.400123  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1928  periplasmic binding protein  26.44 
 
 		 307 aa  43.1  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.967613  normal  0.0105947 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1937  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  25.75 
 
 		 398 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.189462  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2083  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  25.75 
 
 		 429 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.108843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>