More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4009 on replicon NC_007488
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007488  RSP_4009  phosphotransacetylase  100 
 
 
332 aa  647    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.991333  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1008  phosphate acetyltransferase  76.9 
 
 
318 aa  457  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1640  phosphate acetyltransferase  76.9 
 
 
318 aa  457  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4275  phosphate acetyltransferase  76.9 
 
 
318 aa  457  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.782609  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4869  phosphate acetyltransferase  53.1 
 
 
344 aa  330  3e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.70933 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3501  phosphate acetyltransferase  52.78 
 
 
325 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.85802  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3772  phosphotransacetylase  51.68 
 
 
345 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6206  phosphate acetyltransferase  49.24 
 
 
343 aa  310  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235259  normal  0.547085 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2847  phosphotransacetylase  56.71 
 
 
335 aa  303  2.0000000000000002e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.233473  normal  0.727576 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4368  phosphate acetyltransferase  48.75 
 
 
344 aa  300  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1825  phosphate acetyl transferase  50.29 
 
 
341 aa  296  3e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.468792  normal  0.990644 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0690  phosphotransacetylase  48.12 
 
 
345 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00978626  normal  0.268816 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4517  phosphate acetyltransferase  50.62 
 
 
363 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.448767 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1994  phosphotransacetylase  50.31 
 
 
344 aa  287  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172621  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0646  phosphate acetyltransferase  47.34 
 
 
326 aa  280  3e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00657462  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1171  phosphate acetyltransferase  45.15 
 
 
334 aa  280  4e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.910549  normal  0.174379 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2706  phosphate acetyltransferase  46.53 
 
 
333 aa  278  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.489379  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1732  phosphotransacetylase  44.38 
 
 
332 aa  272  6e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00629066  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1035  phosphotransacetylase  45.62 
 
 
333 aa  271  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000802178  hitchhiker  0.00000181375 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3395  phosphate acetyltransferase  43.81 
 
 
333 aa  269  5e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000137184  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1947  phosphate acetyltransferase  45.62 
 
 
333 aa  268  8e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1290  phosphate acetyltransferase  43.67 
 
 
334 aa  268  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.382102  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2276  phosphate acetyltransferase  45.62 
 
 
333 aa  267  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000840515  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1696  phosphotransacetylase  44.55 
 
 
333 aa  266  2e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.593384  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1614  phosphotransacetylase  43.9 
 
 
332 aa  267  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000537063  hitchhiker  9.00938e-19 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10200  phosphate acetyltransferase  44.71 
 
 
332 aa  267  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000038792  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1029  phosphotransacetylase  45.59 
 
 
358 aa  265  7e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0296281  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1978  phosphotransacetylase  44.24 
 
 
333 aa  263  3e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2137  phosphate acetyltransferase  44.85 
 
 
331 aa  261  8e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000856867  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2850  phosphate acetyl/butaryl transferase  45.32 
 
 
333 aa  261  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2542  phosphate acetyltransferase  45.57 
 
 
333 aa  256  3e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5955599999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1210  phosphate acetyltransferase  42.6 
 
 
333 aa  256  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270229  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1326  phosphate acetyltransferase  44.85 
 
 
331 aa  255  8e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0780442  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1728  phosphate acetyltransferase  46.89 
 
 
332 aa  255  9e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0293316  normal  0.0937658 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06290  phosphotransacetylase  46.58 
 
 
333 aa  249  5e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0250109 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3240  phosphate acetyltransferase  44.07 
 
 
703 aa  248  7e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1494  phosphate acetyltransferase  42.6 
 
 
332 aa  248  1e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000278764  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0620  phosphate acetyltransferase  41.03 
 
 
334 aa  244  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00611746  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3679  phosphotransacetylase  45.23 
 
 
338 aa  239  4e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02349  predicted phosphotransacetylase subunit  45.23 
 
 
338 aa  238  9e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1212  phosphate acetyltransferase  45.23 
 
 
338 aa  238  9e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2587  phosphotransacetylase  45.23 
 
 
338 aa  238  9e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02311  hypothetical protein  45.23 
 
 
338 aa  238  9e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1219  phosphotransacetylase  45.23 
 
 
338 aa  238  9e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2735  phosphotransacetylase  45.23 
 
 
338 aa  238  9e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1824  phosphotransacetylase  44.21 
 
 
326 aa  238  1e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0076  phosphate acetyltransferase  40.63 
 
 
341 aa  237  2e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0767  phosphate acetyltransferase  40.61 
 
 
330 aa  238  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.177923  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1296  phosphotransacetylase  41.95 
 
 
325 aa  238  2e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2604  phosphotransacetylase  44.92 
 
 
338 aa  236  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2659  phosphotransacetylase  45.23 
 
 
338 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.918337  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2824  phosphotransacetylase  44.92 
 
 
338 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2726  phosphotransacetylase  45.23 
 
 
338 aa  235  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.335854  normal  0.646434 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2833  phosphotransacetylase  44.92 
 
 
338 aa  235  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2611  phosphotransacetylase  44.92 
 
 
338 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3046  phosphate acetyltransferase  43.33 
 
 
689 aa  233  3e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1048  phosphate acetyltransferase  41.18 
 
 
700 aa  232  5e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2700  phosphotransacetylase  44.31 
 
 
338 aa  232  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.273315  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0042  phosphate acetyltransferase  39.76 
 
 
335 aa  231  1e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1821  phosphotransacetylase  42.99 
 
 
333 aa  230  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000135779  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0414  phosphate acetyltransferase  40.18 
 
 
335 aa  231  2e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0398  phosphotransacetylase  43.67 
 
 
324 aa  230  3e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.294094  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1724  phosphate acetyltransferase  43.43 
 
 
327 aa  229  5e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4480  phosphate acetyltransferase  41.41 
 
 
698 aa  229  6e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1092  phosphotransacetylase  44.59 
 
 
330 aa  228  9e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000027546  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0055  phosphate acetyltransferase  39.51 
 
 
692 aa  227  2e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4809  phosphate acetyltransferase  40.06 
 
 
701 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.932009 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5441  phosphotransacetylase  43.91 
 
 
323 aa  226  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1082  phosphotransacetylase  40.61 
 
 
336 aa  227  3e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.231679 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5516  phosphotransacetylase  43.91 
 
 
323 aa  226  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5180  phosphotransacetylase  43.91 
 
 
323 aa  227  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5238  phosphotransacetylase  43.91 
 
 
323 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5085  phosphotransacetylase  43.91 
 
 
323 aa  226  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5636  phosphotransacetylase  43.91 
 
 
323 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5510  phosphotransacetylase  43.91 
 
 
323 aa  226  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2007  phosphate acetyltransferase  43.43 
 
 
711 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5481  phosphotransacetylase  43.91 
 
 
323 aa  226  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1035  phosphate acetyltransferase  40.12 
 
 
702 aa  226  4e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0294331  normal  0.684952 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5566  phosphotransacetylase  43.91 
 
 
323 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1079  phosphate acetyltransferase  43.73 
 
 
716 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1472  phosphate acetyltransferase  41.8 
 
 
699 aa  226  5.0000000000000005e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.253391 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12240  phosphotransacetylase  43.81 
 
 
331 aa  226  6e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1378  phosphotransacetylase  41.72 
 
 
588 aa  225  7e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.926541  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1045  phosphate acetyltransferase  40.06 
 
 
702 aa  224  1e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5068  phosphotransacetylase  43.59 
 
 
323 aa  224  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2896  phosphate acetyltransferase  44.31 
 
 
714 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0615  phosphate acetyltransferase  40.62 
 
 
714 aa  224  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3908  phosphotransacetylase  43.27 
 
 
323 aa  223  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11260  phosphotransacetylase  43.07 
 
 
695 aa  223  3e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.182034  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0721  phosphotransacetylase  41.23 
 
 
566 aa  223  3e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000504699  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0051  phosphate acetyltransferase  42.9 
 
 
703 aa  223  4e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.833181 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1420  phosphotransacetylase  42.95 
 
 
327 aa  223  4e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00576115  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0834  phosphate acetyltransferase  43.43 
 
 
715 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.239036  normal  0.0501662 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0624  phosphate acetyltransferase  40.74 
 
 
568 aa  222  4.9999999999999996e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3472  phosphotransacetylase  44.94 
 
 
326 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0643  phosphate acetyltransferase  43.63 
 
 
687 aa  222  8e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0236  phosphotransacetylase  42.81 
 
 
329 aa  222  9e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2577  phosphate acetyltransferase  40.96 
 
 
695 aa  222  9e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.901463 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0262  phosphate acetyltransferase  41.41 
 
 
683 aa  222  9e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1231  phosphotransacetylase  41.59 
 
 
327 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>